Item request has been placed! ×
Item request cannot be made. ×
loading  Processing Request

Molecular genetic structure of Mycobacterium tuberculosis in Krasnoyarsk region ; Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis из Красноярского края

Item request has been placed! ×
Item request cannot be made. ×
loading   Processing Request
اقرأ أكثر حفظ في قائمتي
  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Работа выполнена при поддержке гранта Российского научного фонда (№ 23-15-00280).
    • بيانات النشر:
      Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems
    • الموضوع:
      2026
    • Collection:
      Acta Biomedica Scientifica
    • نبذة مختصرة :
      Introduction. Despite the improvement of the general epidemiological situation for tuberculosis (TB) in Krasnoyarsk region, the spread of multiple and pre-extensive drug resistance (MDR and pre-XDR) of the pathogen remains a serious problem that requires a comprehensive analysis of factors, including an assessment of the circulating population of Mycobacterium tuberculosis.Objective. To assess the molecular genetic structure of M. tuberculosis strains in Krasnoyarsk region.Materials and methods. A total of 400 strains were studied for 2024 using SNPand MIRU-VNTR-24 typing.Results. High levels of MDR (64.5 %), including pre-XDR (45.0 %) and XDR (1.5 %), were detected in the sample of M. tuberculosis strains. The dominance of L2 (Beijing genotype) was found in newly diagnosed cases (72.1 %) and previously treated patients (85.6 %). Non-Beijing strains belonged to the L4 genotypes (LAM, Ural, Haarlem and S). The most common Beijing subtypes were B0/W148 (49.5 %; 198/400) and Central Asian Russian (25.0 %; 99/400), they differed significantly in MDR levels (96.5 % and 36.4 %, respectively, by subtype; p < 0.001). Beijing B0/W148 strains had the highest levels of preXDR (71.7 %) and XDR (3.0 %). MDR among L4 strains (30.1 %) was significantly lower compared to Beijing (76.4 %) (p < 0.001). Strains from HIV-TB patients were more common with an MDR profile (74.4 %) than from patients without HIV infection (60.4 %) (p = 0.008) against the background of a higher presence of Beijing B0/W148 in the HIVTB group (59.8 % versus 45.2 %; p = 0.008).Conclusion. Beijing B0/W148 strains account for about half of the study sample and make a significant contribution to the pre-XDR (78.9 %) and XDR (100 %), which requires further monitoring and enhanced control of treatment effectiveness. ; Обоснование. Несмотря на улучшение общей эпидемиологической ситуации по туберкулезу (ТБ) в Красноярском крае, распространение множественной и преширокой лекарственной устойчивости (МЛУ и пре-ШЛУ) возбудителя остается серьезной проблемой, ...
    • File Description:
      application/pdf
    • Relation:
      https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/5752/3185; Global tuberculosis report 2024. Geneva: World Health Organization; 2024. Licence: CC BY-NC-SA 3.0 IGO. URL: https://www.who.int/teams/global-programme-on-tuberculosis-and-lung-health/tb-reports/global-tuberculosis-report-2024 [date of access: Jul 18, 2025].; Васильева И.А. Вопросы повышения качества противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации. 2023. URL: https://orenotd.orb.ru/upload/uf/6bc/r5ddprn0bgm612smhnqzvkxerk99qp2e/Vasileva-28.09.2023-VKS-Minzdrav-_5_5_-.pdf. [date of access: Jul 18, 2025].; Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Киселева Е.А., Черноусова Л.Н., Эргешов А.Э. Сравнительная молекулярно-генетическая характеристика культур Mycobacterium tuberculosis, выделенных в Европейской части Российской Федерации в 1998–2003 гг. и 2016– 2021 гг. Туберкулез и болезни легких. 2023; 101(3): 27-36. doi:10.58838/2075-1230-2023101-3-27-36; Павленок И.В., Турсунова Н.В., Лацких И.В., Нарышкина С.Л., Смолина Е.А. Основные показатели противотуберкулезной деятельности в Сибирском и Дальневосточном федеральном округе (статистические материалы). – Новосибирск: 2023; 111.; Туберкулез у взрослых. 2024. Клинические рекомендации. URL: https://rof-tb.ru/upload/iblock/140/r9ijz6oxq65de3ud5unrvzfaph7hg7wi.pdf. [date of access: Jul 18, 2025].; Лебедева И.Б., Жданова С.Н., Кондратов И.Г., Сибиль К.В., Огарков О.Б., Брусина Е.Б. Генетическая структура и лекарственная устойчивость популяции Mycobacterium tuberculosis в Кемеровской области – Кузбассе. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2023; 100(6): 428-441. doi:10.36233/03729311-449; Жданова С.Н., Вязовая А.А., Лебедева И.Б., Синьков В.В., Кондратов И.Г., Шварц Я.Ш., и др. Циркуляция штаммов Mycobacterium tuberculosis Beijing Central Asian Outbreak в Кемеровской области — Кузбассе в 2018–2022 годах. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024; 101(5): 628-640. doi:10.36233/0372-9311-571; Shitikov E, Bespiatykh D. A revised SNP-based barcoding scheme for typing Mycobacterium tuberculosis complex isolates. mSphere. 2023; 8(4): e0016923. doi:10.1128/msphere.00169-23; Мокроусов И.В., Вязовая А.А., Бадлеева М.В., Герасимова А.А., Белопольская О.Б., Машарский А.Э., и др. Молекулярная детекция и филогеография гипервирулентного субтипа Мycobacterium tuberculosis Вeijing 14717-15. Инфекция и иммунитет. 2023; 13(1): 91-99. doi:10.15789/2220-7619-MDA-2082; Shitikov E, Kolchenko S, Mokrousov I, Bespyatykh J, Ischenko D, Ilina E, et al. Evolutionary pathway analysis and unified classification of East Asian lineage of Mycobacterium tuberculosis. Sci Rep. 2017; 7(1): 9227. doi:10.1038/s41598-017-10018-5; Merker M, Blin C, Mona S, Duforet-Frebourg N, Lecher S, Willery E, et al. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nat. Genet. 2015; 47(3): 242-249. doi:10.1038/ng.3195; ВОЗ. Глобальная стратегия геномного эпиднадзора за возбудителями болезней, обладающих пандемическим и эпидемическим потенциалом, 2022–2032 гг. Женева: Всемирная организация здравоохранения; 2022. URL: https://cdn.who.int/media/docs/default-source/genomic-surveillance-strategy/ru-who_genomics-infographic.pdf. [date of access: Jul 18, 2025].; Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Хафизов К.Ф., и др. Стратегия геномного эпидемиологического надзора. Проблемы и перспективы. Журнал Микробиологии Эпидемиологии и Иммунобиологии. 2024; 101(2): 163–172. doi:10.36233/0372-9311-507; О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2023 году: Государственный доклад. Москва: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2024: 364 с. URL: https://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=27779 [date of access: Jul 18, 2025].; Васильева И.А., Стерликов С.А., Тестов В.В., Михайлова Ю.В., Голубев Н.А., Кучерявая Д.А., и др. Ресурсы и деятельность противотуберкулёзных организаций Российской Федерации в 2022–2023 гг. М.: РИО ЦНИИОИЗ, 2024: 94 с. URL: https://edu.nmrc.ru/wp-content/uploads/2024/12/%D0%A0%D0%B5%D1%81%D1%83%D1%80%D1%81%D1%8B-.pdf. [date of access: Jul 18, 2025].; Mokrousov I, Badleeva M, Mudarisova R, Kozhevnikov V, Markhaev A, Guntupova A, et al. Increasing circulation of multi-drug resistant tuberculosis strains in Buryatia, high-burden and ethnically diverse region in the Russian Far East. Tuberculosis (Edinb). 2024; 149: 102555. doi:10.1016/j.tube.2024.102555; Vyazovaya A, Felker I, Schwartz Y, Mokrousov I. Population structure of Mycobacterium tuberculosis from referral clinics in Western Siberia, Russia: Before and during the Covid-19 pandemic. Infect Genet Evol. 2022; 103: 105343. doi:10.1016/j.meegid.2022.105343; Жданова С.Н., Кондратов И.Г., Огарков О.Б. Выявление Mycobacterium tuberculosis Beijing Central Asian Outbreak в Иркутской области. Acta Biomedica Scientifica. 2024; 9(4): 237-247. doi:10.29413/ABS.2024-9.4.26; Casali N, Nikolayevskyy V, Balabanova Y, Harris SR, Ignatyeva O, Kontsevaya I, et al. Evolution and transmission of drug-resistant tuberculosis in a Russian population. Nature Genet. 2014; 46(3): 279–286. doi:10.1038/ng.2878; Zhdanova S, Jiao WW, Sinkov V, Khromova P, Solovieva N, et al. Insight into Population Structure and Drug Resistance of Pediatric Tuberculosis Strains from China and Russia Gained through Whole-Genome Sequencing. International Journal of Molecular Sciences. 2023; 24(12): 10302. doi:10.3390/ijms241210302; Guo S, Chongsuvivatwong V, Lei S. Comparison on Major Gene Mutations Related to Rifampicin and Isoniazid Resistance between Beijing and Non-Beijing Strains of Mycobacterium tuberculosis: A Systematic Review and Bayesian Meta-Analysis. Genes (Basel). 2022; 13(10): 1849. doi:10.3390/genes13101849; Vyazovaya A, Gerasimova A, Mudarisova R, Terentieva D, Solovieva N, Zhuravlev V, et al. Genetic Diversity and Primary Drug Resistance of Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype Strains in Northwestern Russia. Microorganisms. 2023; 11(2): 255. doi:10.3390/microorganisms11020255; Schwartz Y, Vyazovaya A, Tursunova N, Mokrousov I. Impact of the COVID-19 pandemic on the epidemiology and clinical course of tuberculosis: expected and paradoxical consequences. BMC Infect Dis. 2025; 25(1): 417. doi:10.1186/s12879-025-10793-x; Жданова С.Н., Винокурова М.К., Кондратов И.Г., Евдокимова Н.Е., Синьков В.В., Алексеева Г.И., и др. Изменения молекулярно-генетической структуры Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутии) за 2009–2024 годы: распространение субтипа Beijing B0/W148. Acta Biomedica Scientifica. 2025; 10(2): 239-248. doi:10.29413/ABS.2025-10.2.24; Mokrousov I, Vinogradova T, Dogonadze M, Zabolotnykh N, Vyazovaya A, Vitovskaya M, et al. A multifaceted interplay between virulence, drug resistance, and the phylogeographic landscape of Mycobacterium tuberculosis. Microbiol Spectr. 2023; 11(5): e0139223. doi:10.1128/spectrum.01392-23; Mokrousov I. Origin and dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Haarlem genotype: Clues from its phylogeographic landscape and human migration. Mol Phylogenet Evol. 2024; 195: 108045. doi:10.1016/j.ympev.2024.108045; Цыбикова Э.Б. Туберкулез, сочетанный с ВИЧ-инфекцией, в России в период до и во время пандемии COVID-19. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2022; 14(4): 29-35. doi:10.22328/2077-9828-2022-14-4-29-35; Saavedra Cervera B, López MG, Chiner-Oms Á, García AM, Cancino-Muñoz I, Torres-Puente M, et al. Finegrain population structure and transmission patterns of Mycobacterium tuberculosis in southern Mozambique, a high TB/HIV burden area. Microb Genom. 2022; 8(7): mgen000844. doi:10.1099/mgen.0.000844; https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/5752
    • الرقم المعرف:
      10.29413/ABS.2025-10.6.20
    • الدخول الالكتروني :
      https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/5752
      https://doi.org/10.29413/ABS.2025-10.6.20
    • Rights:
      Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). ; Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
    • الرقم المعرف:
      edsbas.D550F1E2