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Prise en main de l’application web ORIOLE avec l’analyse des poids vifs des femelles Romane en gestation ; Prise en main de l’application web ORIOLE avec l’analyse des poids vifs des femelles Romane en gestation: Cette vidéo illustre la prise en main de l’application web ORIOLE (OutlieRs detectIOn waLk wEighing). (https://oriole.sk8.inrae.fr/ ). Cette application est GRATUITE et de libre-service et on l’utilise pour le filtrage automatique des valeurs aberrantes dans de grandes bases de données produites lors des enregistrements avec le WoW (Walk-over-Weighing). L’ auteur, Irene Llach Martínez, assistante ingénieur à la UMR SELMET (Système d’Élevages Méditerranéens et Tropicaux) de l’INRAE, l’avait réalisé comme outil d’appui à la formation des agents utilitaires du dispositif WoW, en occurrence ceux du Domaine de La Fage en Aveyron, unité expérimentale de l’INRAE. La vidéo d’abord explique ce qu’est ORIOLE et ensuite, l’explication de comment réaliser le téléchargement de la base de données, pour enfin, comment procéder à la compréhension et interprétation des résultats que l’on obtient avec ORIOLE.Un peu d’histoire. Le dispositif WoW (Walk-over-Weighing) a été créé par le Directeur de Recherches, Eliel González García de l‘UMR SELMET-INRAE Occitanie-Montpellier, à partir d’un crédit incitatif reçu en 2015. Le WoW, c’est une plateforme de pesé automatique pour les ovins. Les animaux la traversent volontairement plusieurs fois dans la journée pour accéder à une zone fermée où il y a des attrayants comme l’eau, les minéraux, le sel, etc. En tout moment, ils peuvent sortir par une porte à sens unique. Il est autonome en énergie grâce à un panneau solaire qui charge une batterie pour maintenir allumés les appareils. Il est portable est peut-être déplacé de parcelle pour suivre le troupeau. Le dispositif est équipé d’un lecteur que grâce à l’antenne à laquelle il est relié, lit la boucle électronique que chaque animal a accrochée à l’oreille. Ensuite, par via Bluetooth, le lecteur envoie le numéro d’identification électronique (IDE) à l’indicateur de pesé qui, en même temps, enregistre le poids vif (PV) de l’animal, l’heure et le jour. Ce dispositif produit une grande base de données et parfois, elles entrainent valeurs aberrantes en poids extrêmes. Valeurs trop élevées dues à l’enregistrement de deux animaux pesés en même temps ou valeurs trop basses, parce que l’animal a mis la moitié du corps sur la plateforme et il a été lu par le lecteur ; l’on peut aussi avoir l’IDE d’un animal sans poids vifs ou à l’inverse, de valeurs de PV sans IDE. Un grand nettoyage est nécessaire pour l’obtention du poids réel de chaque animal.Diverses expérimentations ont été réalisées, mais avec une contrainte, le nettoyage de la base de données n’était pas automatisé, et c’est grâce au financement du projet européen TechCare, que cette phase a été résolue [Programme Horizon 2020 No 862050 ; (septembre 2021 - août 2025) ; https://techcare-project.eu/ ]. Pour automatiser ce processus en collaboration avec l’équipe de mathématiciens de l’UMR MISTEA-INRAE Occitanie-Montpellier, l’algoritme kfino (Kalman Filter with Impulse Noised Outliers) a été créé comme une extension de l’algorithme kalman pour le filtrage de grands nombres de valeurs aberrantes. Et juste après, il y a eu l’apparition d’ORIOLE (OutlieRs detectIOn waLk wEighing), une application web GRATUITE et de libre-service pour le filtrage automatique des valeurs aberrantes dans les bases de données produites par le dispositif WoW. ORIOLE fonctionne avec le package R-Shiny stocké dans le service d’hébergement de l’INRAE (Projet SK8). Une fois que l’on télécharge la base de données enregistrées par le WoW, ORIOLE analyse les données avec kfino et après nettoyage, donne des résultats en forme de graphiques et de tableau Excel pour toute la période enregistrée. Par exemple, il montre le graphique de l’évolution du poids individuel et du troupeau en moyenne journalières, aussi l’on peut voir en histogramme la fréquence de passages journaliers individuels ou de tout le troupeau, également, il montre de graphiques de l’évolution journalières du poids vif par individu. Comme tableau en format csv. on obtient le résumé du traitement fait par kfino pour toutes les données téléchargées, par individu et par jour. Tous ses résultats sont téléchargeables.

Subjects: app web ORIOLE; WoW (Walk-over-Weighing); Liveweight gain

  • Source: https://hal.inrae.fr/hal-05072099 ; 2025.

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