Item request has been placed! ×
Item request cannot be made. ×
loading  Processing Request

Fine mapping and candidate gene analysis of CRA8.1.6, which confers clubroot resistance in turnip (Brassica rapa ssp. rapa) ... : رسم الخرائط الدقيقة وتحليل الجينات المرشحة لـ CRA8.1.6، مما يمنح مقاومة للنادي في اللفت (Brassica rapa ssp. rapa) ...

Item request has been placed! ×
Item request cannot be made. ×
loading   Processing Request
  • معلومة اضافية
    • بيانات النشر:
      OpenAlex
    • الموضوع:
      2024
    • Collection:
      DataCite Metadata Store (German National Library of Science and Technology)
    • نبذة مختصرة :
      Clubroot disease poses a significant threat to Brassica crops, necessitating ongoing updates on resistance gene sources. In F 2 segregants of the clubroot-resistant inbred line BrT18-6-4-3 and susceptible DH line Y510, the genetic analysis identified a single dominant gene responsible for clubroot resistance. Through bulk segregant sequencing analysis and kompetitive allele-specific polymerase chain reaction assays, CRA8.1.6 was mapped within 110 kb (12,255–12,365 Mb) between markers L-CR11 and L-CR12 on chromosome A08. We identified B raA08g015220.3.5C as the candidate gene of CRA8.1.6 . Upon comparison with the sequence of disease-resistant material BrT18-6-4-3, we found 249 single-nucleotide polymorphisms, seven insertions, six deletions, and a long terminal repeat (LTR) retrotransposon (5,310 bp) at 909 bp of the first intron. However, the LTR retrotransposon was absent in the coding sequence of the susceptible DH line Y510. Given the presence of a non-functional LTR insertion in other materials, it ... : يشكل مرض كلوبروت تهديدًا كبيرًا لمحاصيل الكرنب، مما يستلزم تحديثات مستمرة حول مصادر جينات المقاومة. في فواصل F 2 للخط الأصلي المقاوم للنادي الجذري BrT18 -6-4-3 وخط DH الحساس Y510، حدد التحليل الجيني جينًا سائدًا واحدًا مسؤولًا عن مقاومة النادي الجذري. من خلال تحليل تسلسل الفصل السائب وفحوصات تفاعل البوليميراز المتسلسل الخاصة بالأليلات التنافسية، تم تعيين CRA8.1.6 في حدود 110 كيلوبايت (12،255-12،365 ميجابايت) بين العلامات L - CR11 و L - CR12 على الكروموسوم A08. حددنا B raA08g015220.3.5C على أنه الجين المرشح لـ CRA8.1.6 . عند المقارنة مع تسلسل المواد المقاومة للأمراض BrT18 -6-4-3، وجدنا 249 تعدد أشكال أحادي النوكليوتيد، وسبع عمليات إدخال، وست عمليات حذف، ونقل خلفي طويل الأمد (5310 نقطة أساس) عند 909 نقطة أساس للإنترون الأول. ومع ذلك، كان ناقل الحركة الخلفي LTR غائبًا في تسلسل الترميز لخط DH الحساس Y510. بالنظر إلى وجود إدخال LTR غير وظيفي في مواد أخرى، فقد أظهر أن إدخال LTR قد لا يكون مرتبطًا بالحساسية. كشف تحليل محاذاة التسلسل أن الإكسون الرابع للخط الحساس يحتوي على حذفين وإدخال، مما يؤدي إلى طفرة إزاحة ...
    • Relation:
      https://dx.doi.org/10.60692/g43xc-4kq64
    • الرقم المعرف:
      10.60692/vt4s7-5y206
    • Rights:
      cc-by
    • الرقم المعرف:
      edsbas.F944750A