Genetic mapping of the root-mycobiota in rice and its role in drought tolerance ... : رسم الخرائط الجينية للميكروبات الجذرية في الأرز ودورها في تحمل الجفاف ...

Background Rice is the second most produced crop worldwide, but it is highly susceptible to drought-induced yield loss. Micro-organisms can potentially alleviate the negative effects of drought but how they are associated with their host is unclear. The aim of the present study was to unravel the genetic factors involved in this process, and whether it plays a role in rice drought tolerance. Results To achieve this, we characterized the composition of the root-mycobiota in 296 rice accessions ( Oryza sativa L. subsp. indica), grown in the field under control and drought conditions. A Genome Wide Association Study (GWAS) was used to identify marker-trait associations between rice Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers and root mycobiota. This resulted in the identification of ten significant (LOD > 4) SNPs associated with six root associated fungi and four significant SNPs associated with fungi-mediated drought tolerance. The analysis of the genes underlying the loci of the significant ... : الأرز هو ثاني أكثر المحاصيل إنتاجًا في جميع أنحاء العالم، لكنه عرضة بشكل كبير لفقدان الغلة الناجم عن الجفاف. يمكن للكائنات الحية الدقيقة أن تخفف من الآثار السلبية للجفاف ولكن كيفية ارتباطها بمضيفها غير واضحة. كان الهدف من هذه الدراسة هو كشف العوامل الوراثية التي تنطوي عليها هذه العملية، وما إذا كانت تلعب دورًا في تحمل جفاف الأرز. ولتحقيق ذلك، قمنا بتمييز تركيبة الفطريات الجذرية في 296 ملحقًا للأرز ( Oryza sativa L. subsp. indica)، المزروعة في الحقل تحت السيطرة وظروف الجفاف. تم استخدام دراسة ارتباط الجينوم الواسع (GWAS) لتحديد ارتباطات السمات الواسمة بين علامات تعدد أشكال النيوكليوتيدات المفردة (SNP) للأرز والحيوانات الفطرية الجذرية. وأدى ذلك إلى تحديد عشرة تجمعات ملحوظة (LOD > 4) مرتبطة بستة فطريات مرتبطة بالجذر وأربعة تجمعات ملحوظة مرتبطة بتحمل الجفاف بوساطة الفطريات. حدد تحليل الجينات الكامنة وراء مواضع ارتباطات السمات المميزة المهمة مرشحين بداهة بما في ذلك الجينات المعروفة بمشاركتها في الدفاع عن مسببات الأمراض واستجابات الإجهاد اللاأحيائي وعمليات إعادة تشكيل جدار الخلية. تظهر دراستنا أن جينات الأرز ...