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The economic, medical and psychosocial consequences of whole genome sequencing for the genetic diagnosis of patients with intellectual disability: The DEFIDIAG study protocol

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  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon); Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques (CIC-EC); Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Equipe EPICAD (LNC - U1231); Lipides - Nutrition - Cancer Dijon - U1231 (LNC); Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro); Délégation à la recherche clinique et à l'innovation CHU Dijon (DRCI); CHU Pitié-Salpêtrière AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU); Sorbonne Université (SU); Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy); Centre d'investigation clinique Nancy (CIC); Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL); Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées Brétigny-sur-Orge (IRBA); Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille); Centre d'investigation clinique - Epidémiologie clinique Nancy (CIC-EC); Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL); Pôle de Recherche Clinique Paris (PRC); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Université Bourgogne Franche-Comté COMUE (UBFC); FHU TRANSLAD (CHU de Dijon); Equipe GAD (LNC - U1231); Institut de génétique médicale; Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS); Laboratoire de Génétique Médicale (LGM); Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité); Hôpital Necker - Enfants Malades AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP); Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR); Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ); Centre Hospitalier Universitaire de Rennes CHU Rennes = Rennes University Hospital Ponchaillou; Centre de référence Maladies Rares CLAD-Ouest Rennes; Hospices Civils de Lyon (HCL); Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon; CHU Rouen; Normandie Université (NU); Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques (GPMCND); Université de Rouen Normandie (UNIROUEN); Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH); Institut de Biologie François JACOB (JACOB); Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA); TheDEFIDIAG study is funded by grants from the French Ministry of Health in the framewok of the national French initiative for genomic medicine. Institut national de la santé et de la recherche médicale (Inserm) is the sponsor of the DEFDIAG study.
    • بيانات النشر:
      HAL CCSD
      Frontiers Media
    • الموضوع:
      2022
    • Collection:
      Inserm: HAL (Institut national de la santé et de la recherche médicale)
    • نبذة مختصرة :
      International audience ; Introduction: Like other countries, France has invested in a national medical genomics program. Among the four pilot research studies, the DEFIDIAG project focuses on the use of whole genome sequencing (WGS) for patients with intellectual disability (ID), a neurodevelopmental condition affecting 1–3% of the general population but due to a plethora of genes. However, the access to genomic analyses has many potential individual and societal issues in addition to the technical challenges. In order to help decision-makers optimally introduce genomic testing in France, there is a need to identify the socio-economic obstacles and leverages associated with the implementation of WGS. Methods and Analysis: This humanities and social sciences analysis is part of the DEFIDIAG study. The main goal of DEFIDIAG is to compare the percentage of causal genetic diagnoses obtained by trio WGS (including the patient and both parents) (WGS T ) to the percentage obtained using the minimal reference strategy currently used in France (Fragile-X testing, chromosomal microarray analysis, and gene panel strategy including 44 ID genes) for patients with ID having their first clinical genetics consultation. Additionally, four complementary studies will be conducted. First, a cost-effectiveness analysis will be undertaken in a subsample of 196 patients consulting for the first time for a genetic evaluation; in a blinded fashion, WGS T and solo (index case, only) genomic analysis (WGS S ) will be compared to the reference strategy. In addition, quantitative studies will be conducted: the first will estimate the cost of the diagnostic odyssey that could potentially be avoidable with first-line WGS T in all patients previously investigated in the DEFIDIAG study; the second will estimate changes in follow-up of the patients in the year after the return of the WGS T analysis compared to the period before inclusion. Finally, through semi-directive interviews, we will explore the expectations of 60 parents regarding genomic ...
    • Relation:
      info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/35444683; hal-03678712; https://amu.hal.science/hal-03678712; https://amu.hal.science/hal-03678712/document; https://amu.hal.science/hal-03678712/file/Lejeune_fgene-13-852472.pdf; PUBMED: 35444683; PUBMEDCENTRAL: PMC9013934
    • الرقم المعرف:
      10.3389/fgene.2022.852472
    • Rights:
      http://creativecommons.org/licenses/by/ ; info:eu-repo/semantics/OpenAccess
    • الرقم المعرف:
      edsbas.F248B6DC