Contributors: Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM); Biocapteurs-Analyses-Environnement (BAE); Université de Perpignan Via Domitia (UPVD); Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies Microbiennes (LBBM); PIERRE FABRE-EDF (EDF)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB); Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH); Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE); Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux (LIEC); Institut Ecologie et Environnement - CNRS Ecologie et Environnement (INEE-CNRS); Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo); Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC (UMR MARBEC ); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM); Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux (IPREM); Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA); Université de Liège - Gembloux; Hydrosciences Montpellier (HSM); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM); Agroécologie Dijon; Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté COMUE (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro); Institut des Géosciences de l’Environnement (IGE); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ); Université Grenoble Alpes (UGA); Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX); Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE); Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM); Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes (RiverLy); Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM); Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE); Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM); Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); The authors would like to thank their institutions and the Evertéa Foundation for supporting the Ecotoxicomic Network
نبذة مختصرة : International audience ; Environmental pollution is one of the main challenges faced by humanity. By their ubiquity and vast range of metabolic capabilities, microorganisms are affected by pollution with consequences on their host organisms and on the functioning of their environment and also play key roles in the fate of pollutants through the degradation, transformation and transfer of organic or inorganic compounds. They are thus crucial for the development of nature-based solutions to reduce pollution and of bio-based solutions for environmental risk assessment of chemicals. At the intersection between microbial ecology, toxicology and biogeochemistry, microbial ecotoxicology is a fast-expanding research area aiming to decipher the interactions between pollutants and microorganisms. This perspective paper gives an overview of the main research challenges identified by the Ecotoxicomic network within the emerging One Health framework and in the light of ongoing interest in biological approaches to environmental remediation and of the current state of the art in microbial ecology. We highlight prevailing knowledge gaps and pitfalls in exploring complex interactions among microorganisms and their environment in the context of chemical pollution and pinpoint areas of research where future efforts are needed.
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