Estudios moleculares del gen 11 de rotavirus ; Molecular studies of Rotavirus Gene 11

Los mecanismos de variación y evolución en los rotavirus comprenden no sólo lasmutaciones puntuales introducidas por la RNA polimerasa durante la replicación y lareasociación de segmentos virales durante infecciones mixtas, sino también losreordenamientos que se producen dentro de cada segmento genómico. Estos reordenamientosno afectan la estructura conservada de los segmentos genómicos (extremos 5' y 3'conservados), y esta estructura se supone relacionada con la capacidad de replicación yempaquetamiento del genoma viral en nuevas partículas virales. Con el objetivo de estudiar los mecanismos de reordenamiento genómicos en rotavirus seanalizó la estructura molecular del segmento genómico 11 reordenado de distintos rotavirushumanos de "electroferotipo corto", aislados de niños infectados. De acuerdo a los resultadosobtenidos, el segmento 11 reordenado de los aislamientos virales analizados tiene unainserción de 148 nucleótidos en la región 3' no traducida del segmento viral. Las secuenciasobtenidas de los segmentos 11 de los distintos aislamientos virales analizados fueronaltamente homólogas entre sí y con las secuencias de los segmentos 11 de otras dos cepas derotavirus humanos decriptas previamente: RVS y DS-1. La inserción no afecta la regióncodificante del gen 11, ni la secuencia y localización de la región 3' no codificante, común atodos los segmentos 11 de los rotavirus tipo A. La secuencia de la inserción, rica en A y T,no presenta homología con el segmento 11 normal ni con otros segmentos virales. Losresultados obtenidos permitieron identificar y estudiar un nuevo mecanismo dereordenamiento genómico en rotavirus, en el cual no hay una duplicación parcial delsegmento genómico. Un segundo objetivo de la tesis consistió en el desarrollo de un sistema que permita obtenerrotavirus recombinantes. Se estudiaron las secuencias requeridas para que un ARN seareconocido por la maquinaria viral y sea replicado y empaquetado en nuevas partículasvirales. Para estudiar las secuencias involucradas en el reconocimiento ...