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Open science resources from the Tara Pacific expedition across coral reef and surface ocean ecosystems

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  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV); Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV); Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans (GOSEE); Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École Pratique des Hautes Études (EPHE); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Aix Marseille Université (AMU)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université de Toulon (UTLN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes 2016-2019 (UGA 2016-2019 )-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Nord )-Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay)-European Molecular Biology Laboratory (EMBL)-NANTES UNIVERSITÉ - École Centrale de Nantes (Nantes Univ - ECN); Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Université australe du Chili; Institut universitaire de France (IUF); Ministère de l'Education nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (M.E.N.E.S.R.); University of Maine; European Molecular Biology Laboratory Hinxton; Shimoda Marine Research Center; Université de Tsukuba = University of Tsukuba; Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Nicholas School of the Environment; Duke University Durham; Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN); Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA); Institut Fédératif de Recherche - Ressources Marines (IFR MARRES); Université Côte d'Azur (UniCA); Laboratoire International Associé Réponse des Organismes et Populations face au Stress Environnemental - Université Côte d’Azur - Centre Scientifique de Monaco (LIA ROPSE); Université Côte d’Azur - Centre Scientifique de Monaco; Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC); Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB); Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); OSU Stations marines (STAMAR); Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Géochrononologie Traceurs Archéométrie (GEOTRAC); Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement Gif-sur-Yvette (LSCE); Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA); Cycles biogéochimiques marins : processus et perturbations (CYBIOM); Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN); Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)); École normale supérieure - Paris (ENS-PSL); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales Toulouse (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales Toulouse (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales Toulouse (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité); Weizmann Institute of Science Rehovot, Israël; Universität Konstanz; Department of Earth Sciences USC Los Angeles; University of Southern California (USC); Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR); Maison de la Modélisation, de la Simulation et des Interactions Sophia-Antipolis (MSI); Oregon State University (OSU); Centro de Investigaciones Biologicas del Noroeste Mexico (CONACYT-CIBNOR); Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología Mexico (CONACYT); Génomique métabolique (UMR 8030); Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE); Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Processus et interactions de fine échelle océanique (PROTEO); Tara Ocean Foundation; Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS); Département de Biologie - ENS Paris; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques (LECOB); Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB); Centre Scientifique de Monaco (CSM); Ohio State University Columbus (OSU); Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics; Martin Ryan Institute; National University of Ireland Galway (NUI Galway); ANR-21-ESRE-0038,AO-EMBRC,Augmented Observatories of the National Marine Biological Resource Centre (EMBRC-France)(2021); ANR-10-LABX-0019,LabexMER,LabexMER Marine Excellence Research: a changing ocean(2010)
    • بيانات النشر:
      HAL CCSD
      Nature Publishing Group
    • الموضوع:
      2023
    • Collection:
      Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHM): HAL
    • نبذة مختصرة :
      International audience ; the Tara Pacific expedition (2016-2018) sampled coral ecosystems around 32 islands in the Pacific Ocean and the ocean surface waters at 249 locations, resulting in the collection of nearly 58 000 samples. The expedition was designed to systematically study warm-water coral reefs and included the collection of corals, fish, plankton, and seawater samples for advanced biogeochemical, molecular, and imaging analysis. Here we provide a complete description of the sampling methodology, and we explain how to explore and access the different datasets generated by the expedition. Environmental context data were obtained from taxonomic registries, gazetteers, almanacs, climatologies, operational biogeochemical models, and satellite observations. The quality of the different environmental measures has been validated not only by various quality control steps, but also through a global analysis allowing the comparison with known environmental large-scale structures. Such publicly released datasets open the perspective to address a wide range of scientific questions.
    • Relation:
      hal-04164118; https://hal.science/hal-04164118; https://hal.science/hal-04164118/document; https://hal.science/hal-04164118/file/s41597-022-01757-w.pdf; WOS: 001005703300001
    • الرقم المعرف:
      10.1038/s41597-022-01757-w
    • Rights:
      info:eu-repo/semantics/OpenAccess
    • الرقم المعرف:
      edsbas.E8A94B25