Tuberculosis severity associates with variants and eQTLs related to vascular biology and infection-induced inflammation ... : ترتبط شدة السل بالمتغيرات و eQTLs المتعلقة ببيولوجيا الأوعية الدموية والالتهاب الناجم عن العدوى ...

Tuberculosis (TB) remains a major public health problem globally, even compared to COVID-19. Genome-wide studies have failed to discover genes that explain a large proportion of genetic risk for adult pulmonary TB, and even fewer have examined genetic factors underlying TB severity, an intermediate trait impacting disease experience, quality of life, and risk of mortality. No prior severity analyses used a genome-wide approach.As part of our ongoing household contact study in Kampala, Uganda, we conducted a genome-wide association study (GWAS) of TB severity measured by TBScore, in two independent cohorts of culture-confirmed adult TB cases (n = 149 and n = 179). We identified 3 SNPs (P<1.0 x 10-7) including one on chromosome 5, rs1848553, that was GWAS significant (meta-analysis p = 2.97x10-8). All three SNPs are in introns of RGS7BP and have effect sizes corresponding to clinically meaningful reductions in disease severity. RGS7BP is highly expressed in blood vessels and plays a role in infectious ... : لا يزال السل يمثل مشكلة صحية عامة رئيسية على مستوى العالم، حتى بالمقارنة مع كوفيد-19. فشلت الدراسات على مستوى الجينوم في اكتشاف الجينات التي تفسر نسبة كبيرة من المخاطر الوراثية للسل الرئوي لدى البالغين، وقد فحص عدد أقل العوامل الوراثية الكامنة وراء شدة السل، وهي سمة وسيطة تؤثر على تجربة المرض ونوعية الحياة وخطر الوفاة. لم تستخدم أي تحليلات شدة سابقة نهجًا على مستوى الجينوم. كجزء من دراستنا المستمرة للاتصال الأسري في كمبالا، أوغندا، أجرينا دراسة ارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) لشدة السل تم قياسها بواسطة TBScore، في مجموعتين مستقلتين من حالات السل البالغة المؤكدة للثقافة (العدد = 149 والعدد = 179). حددنا 3 SNPs (P<1.0 × 10-7) بما في ذلك واحد على الكروموسوم 5، rs1848553، الذي كان مهمًا لـ GWAS (التحليل التلوي p = 2.97 × 10-8). جميع SNPs الثلاثة هي في إنترونات من RGS7BP ولها أحجام تأثير تتوافق مع تخفيضات ذات مغزى سريريًا في شدة المرض. يتم التعبير عن RGS7BP بشكل كبير في الأوعية الدموية ويلعب دورًا في التسبب في الأمراض المعدية. حددت الجينات الأخرى ذات الارتباطات الإيحائية مجموعات الجينات المشاركة في توازن ...