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A study on loss functions and decision thresholds for the segmentation of multiple sclerosis lesions on spinal cord MRI

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  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Neuroimagerie: méthodes et applications (EMPENN); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAL, IMAGE ET LANGAGE (IRISA-D6); Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA); Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes); Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique); Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes); Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA); Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique); Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT); Département de Neuroradiology Rennes; Service de Neurologie Rennes = Neurology Rennes; Centre Hospitalier Universitaire de Rennes CHU Rennes = Rennes University Hospital Ponchaillou; ANR-21-RHUS-0014,Primus,Transforming the care of patients with Multiple Sclerosis using a multidimensional data-driven clinical decision support system(2021); ANR-10-COHO-0002,OFSEP,Observatoire Français de la Sclérose en Plaques(2010)
    • بيانات النشر:
      HAL CCSD
    • الموضوع:
      2023
    • Collection:
      Archive ouverte HAL (Hyper Article en Ligne, CCSD - Centre pour la Communication Scientifique Directe)
    • الموضوع:
      Cartagena (Colombia); Colombia
    • نبذة مختصرة :
      International audience ; Multiple sclerosis (MS) patients often present hyper-intense T2-w lesions in the spinal cord. The severe imbalance between background and lesion classes poses a major challenge to Deep Learning segmentation approaches, requiring for ad hoc strategies. Careful selection of the loss function and adjustment of the conventional 0.5-thresholding may help mitigating this issue. Our results show the performance advantages of loss functions based on the Tversky Index and the benefits of threshold tuning over more standard settings and the state-of-the-art model for MS lesion segmentation on spinal cord MRI.
    • Relation:
      hal-03865212; https://hal.science/hal-03865212; https://hal.science/hal-03865212v3/document; https://hal.science/hal-03865212v3/file/ISBI_Primus_10052023.pdf
    • Rights:
      info:eu-repo/semantics/OpenAccess
    • الرقم المعرف:
      edsbas.DBAF016F