Charting Small RNA Landscape – an Exciting Journey in the Postgenomic Era ; Die Vermessung der Landkarte kleiner RNA's - eine aufregende Reise in die postgenomische Ära

This thesis focuses on small regulatory RNAs, which include microRNA (miRNA) and small interfering RNA (siRNA). Using computational methods, I investigated not only the biogenesis of small RNAs, but also the regulatory roles of them. The work covered miRNA gene identification, miRNA promoter analysis, viral small interfering RNA (vsRNA) population analysis and miRNA target interactions. The model organisms studied in this thesis are Arabidopsis thaliana, Sorghum bicolor, 9 plant viruses and Homo sapiens. The phylogenetic heterogeneity of these organisms suggests wide spread regulatory roles of small RNAs in various formats of life. ; In dieser Doktorarbeit wurden kleine regulatorische RNA-Moleküle, insbesondere sogenannte Mikro-RNAs (miRNAs) und kleine interferierende RNAs (siRNAs) bearbeitet. Unter Verwendung computer-gestützter Analysen evaluierte ich neben der Biogenese auch die regulatorischen Rollen kleiner RNAs. Die Studien umfassen die Identifizierung von miRNA Genen und deren Promoteranalysen, die Untersuchung viraler siRNA-Populationen sowie die Interaktionen von miRNAs mit Zielgenen. Die in dieser Arbeit untersuchten Arten umfassen die Ackerschmalwand (Arabidopsis thaliana), die Hirse (Sorghum bicolor), 9 Pflanzenviren und den Menschen (Homo sapiens). Die grosse phylogenetische Vielfalt, die die untersuchten Organismen abdecken, unterstreicht die Bedeutung und weite Verbreitung kleiner RNA-Moleküle und deren regulatorischen Wirkungen.