İthal ayçiçeği (Helianthus annuus L.) tohumlarında Plasmopara halstedii (Farl.)Berl. & De Toni)' nin varlığının moleküler yöntemlerle araştırılması ve mefenoxam'a karşı duyarlılığının saptanması

Özellikle, tohum kaynaklı olan ve tohumla taşınabilen etmenlerin hızlı tanılanması ve bunların kontrol altına alınması sağlıklı bir ürün elde etmenin ilk aşamasını oluşturmaktadır. Bu tez çalışmasının amacı, ithalat aşamasında analiz şartı olan tohum kaynaklı Plasmopara halstedii (Farl.) Berl. ; De Toni)'nin ayçiçeği tohumundaki varlığının klasik yöntemlere göre çok daha avantajlı moleküler yöntemler kullanılarak optimizasyonunun gerçekleştirilmesi ve metalaxyl ile mefenoxam arasındaki duyarlılıklarının değerlendirilmesidir. Klasik PCR (agaroz jel elektroforez) ile ilgili hesaplamaları EPPO Standart Protokolleri Appendix 2 ve Real Time PCR (hidroliz probları) ile ilgili hesaplamalar ise EPPO Standart Protokolleri Appendix 3 referans alınarak optimize edilmiştir. Ayrıca, EPPO Standart Protokollerinde yer almayan Real time PCR (SyberGreen) çalışmasında ise, SyberGreen Mastermix kit protokolü esas alınarak optimize edilmiştir. Böylece, ülkemiz karantina laboratuarları içerisinde her üç moleküler protokülün daha uygulanabilir olması sağlanmıştır. Ayrıca, bu optimizasyon ile etmenin ayçiçeği tohumundan direkt tespitine yönelik ilk moleküler çalışma da gerçekleştirilmiştir. P. halstedii izolatlarının metalaxyl'e duyarlılıklarının azaldığı tüm dünyada bilinmektedir. Bu çalışmada da, söz konusu patojenin metalaxyl'in izomeri olan mefenoxam'a karşı da duyarlılıklarının azaldığı belirlenmiş ve aralarında çapraz dayanıklılık olduğu için metalaxyl ile aynı grupta yer almıştır. ; The fact that rapid diagnosing of especially seed-borne pathogens and their control is the first step to obtain healthy crop. The aims of the study were to optimize the analyzing methods in detecting presence of Plasmopara halstedii (Farl.) Berl. ; De Toni requiring analysis at the time of importation in the sunflower seed using current molecular methods that were much more advantageous than that of classical methods, and to evaluate potential variations in sensitivities of the pathogen to metalaxyl and mefenoxam. Calculations related to classical ...