Proteínas asociadas a vesículas extracelulares tumorales como biomarcadores potenciales en el diagnóstico, progresión y supervivencia en diferentes tipos de cáncer

La investigación tuvo como objetivo evaluar proteínas asociadas a vesículas extracelulares tumorales como biomarcadores potenciales en el diagnóstico, progresión y supervivencia de diferentes tipos de cáncer. Los datos proteómicos primarios fueron obtenidos de bancos de datos de acceso abierto de TCGA para 20 tipos de cáncer y HPA/GTEx para la contraparte en individuos sanos. El valor diagnóstico fue obtenido a partir de 5895 muestras proveniente de pacientes con cáncer y 626 muestras provenientes de individuos sanos; el valor pronóstico se determinó con datos de 5494 pacientes supervivientes y 2202 fallecidos. Se estimó el Q Score de 06 proteínas (CD9, PDCD6IP, HSPA8, ANXA2, ANXA5 y ANXA1) como biomarcadores diagnósticos, siendo la expresión de ANXA1 la más común al alza y a la baja (9 y 8 tipos de cáncer respectivamente). Las expresiones diferenciales pronósticas no favorables mayores fueron GAPDH en cáncer renal; PGK1 en cáncer mamario y ENO1 en cáncer hepático. Para las proteínas de pronóstico favorable las de mejor valor fueron PDCD6IP en cáncer renal; EEF2 en cáncer endometrial y TUBB4B en cáncer tiroideo. La supervivencia a 5 años de los pacientes que expresaron a la baja proteínas pronósticas no favorables fueron: 99% para CCT2 en cáncer prostático; 97% para TFRC en cáncer tiroideo; 87% para PGK1 en cáncer mamario; 83% para YWHAZ en cáncer endometrial 81% para FLOT1 en cáncer colorrectal. La supervivencia a 5 años de los pacientes que expresaron al alza proteínas pronósticas favorables fueron: 100% y 97% para ANXA1 y CD9 en cáncer tiroideo; 90% y 97% para TUBB4B en cáncer endometrial y cáncer tiroideo; y 89% para GNAI2 en cáncer mamario. ; The research aimed to evaluate tumor extracellular vesicle-associated proteins as potential biomarkers in the diagnosis, progression and survival of different types of cancer. The primary proteomic data were obtained from open access TCGA databanks for 20 cancer types and HPA/GTEx for the counterpart in healthy individuals. The diagnostic value was obtained from 5895 ...