Advancing pathogen genomics in resource-limited settings ... : النهوض بعلم الجينوم الممرض في بيئات محدودة الموارد ...

Genomic sequencing has emerged as a powerful tool to enhance early pathogen detection and characterization with implications for public health and clinical decision making. Although widely available in developed countries, the application of pathogen genomics among low-resource, high-disease burden settings remains at an early stage. In these contexts, tailored approaches for integrating pathogen genomics within infectious disease control programs will be essential to optimize cost efficiency and public health impact. We propose a framework for embedding pathogen genomics within national surveillance plans across a spectrum of surveillance and laboratory capacities. We adopt a public health approach to genomics and examine its application to high-priority diseases relevant in resource-limited settings. For each grouping, we assess the value proposition for genomics to inform public health and clinical decision-making, alongside its contribution toward research and development of novel diagnostics, ... : برز التسلسل الجيني كأداة قوية لتعزيز الكشف المبكر عن مسببات الأمراض وتوصيفها مع الآثار المترتبة على الصحة العامة واتخاذ القرارات السريرية. على الرغم من توفره على نطاق واسع في البلدان المتقدمة، إلا أن تطبيق علم الجينوم الممرض بين البيئات ذات الموارد المنخفضة والأمراض المرتفعة لا يزال في مرحلة مبكرة. في هذه السياقات، ستكون النهج المصممة خصيصًا لدمج علم الجينوم الممرض في برامج مكافحة الأمراض المعدية ضرورية لتحسين كفاءة التكلفة وتأثير الصحة العامة. نقترح إطارًا لتضمين علم الجينوم الممرض في خطط المراقبة الوطنية عبر مجموعة من قدرات المراقبة والمختبرات. نعتمد نهج الصحة العامة لعلم الجينوم ونفحص تطبيقه على الأمراض ذات الأولوية العالية ذات الصلة في البيئات المحدودة الموارد. بالنسبة لكل مجموعة، نقوم بتقييم عرض القيمة لعلم الجينوم لإبلاغ الصحة العامة وصنع القرار السريري، إلى جانب مساهمتها في البحث والتطوير في التشخيصات والعلاجات واللقاحات الجديدة. ...