Additional file 1 of Sputum bacterial load and bacterial composition correlate with lung function and are altered by long-term azithromycin treatment in children with HIV-associated chronic lung disease ... : يرتبط الملف الإضافي 1 للحمل البكتيري للبلغم والتكوين البكتيري بوظيفة الرئة ويتم تغييرهما عن طريق علاج الأزيثروميسين طويل الأجل في الأطفال المصابين بمرض الرئة المزمن المرتبط بفيروس نقص المناعة البشرية ...

Additional file 1: Figure S1. A bar plot of the taxa and their relative abundance of the extraction and sequencing mock controls compared to manufacturer profiles. Figure S2. A scatterplot showing the correlation between samples repeated within a run (WR, n = 74) and between runs (BR, n=28). Figure S3. A scatterplot showing the spread of biological samples (n=960) and the negative controls (primestore, n=43) 16S copies vs final number of reads (A1 and A2), Shannon alpha diversity index (B1 and B2) and age of participant in years (C1 and C2). Figure S4. Ordination plots of showing the spread of biological samples (n=960) and the negative controls (primestore, n=43) coloured by their 16S copies. Figure S5. Ordination plots showing the spread of biological samples (n=960) and the negative controls (primestore, n=43) coloured by their number of reads. Figure S6. Ordination plots showing the spread of biological samples (n=960) and the negative controls (primestore, n=43) coloured by the age of the participant. ... : ملف إضافي 1: الشكل S1. مخطط شريطي للأصناف ووفرة نسبية لضوابط الاستخراج والتسلسل الوهمية مقارنة بملفات تعريف الشركة المصنعة. الشكل S2. مخطط مبعثر يوضح العلاقة بين العينات المتكررة داخل التشغيل (WR، n = 74) وبين التشغيلات (BR، n=28). الشكل S3. مخطط مبعثر يوضح انتشار العينات البيولوجية (العدد=960) والضوابط السلبية (المخزن الأولي، العدد =43) نسخ 16S مقابل العدد النهائي للقراءات (A1 و A2)، ومؤشر شانون ألفا للتنوع (B1 و B2) وعمر المشارك بالسنوات (C1 و C2). الشكل S4. مخططات التنسيق لإظهار انتشار العينات البيولوجية (ن=960) والضوابط السلبية (بريمستور، ن=43) الملونة بنسخها 16S. الشكل S5. مخططات التنسيق التي توضح انتشار العينات البيولوجية (العدد=960) والضوابط السلبية (المخزن الأولي، العدد =43) الملونة بعدد قراءاتها. الشكل S6. مخططات التنسيق التي توضح انتشار العينات البيولوجية (العدد=960) والضوابط السلبية (المخزن الأولي، العدد=43) الملونة حسب عمر المشارك. الشكل S7. منحنيات نادرة تظهر عدد من ASVs المكتشفة و 16 S نسخة من العينات. الشكل S8. منحنيات نادرة تظهر عدد ASVs المكتشفة وعدد قراءات العينات. الشكل S9. مخطط شريطي يوضح ...