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COVID-19-Associated Pulmonary Aspergillosis, Fungemia, and Pneumocystosis in the Intensive Care Unit: a Retrospective Multicenter Observational Cohort during the First French Pandemic Wave

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  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals (CNRMA); Institut Pasteur Paris (IP)-Université Paris Cité (UPCité); Génomique évolutive, modélisation et santé (GEMS); Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité); Laboratoire de Parasitologie-Mycologie CHU Saint Louis, Paris; Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal Paris; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP); Mycologie moléculaire - Molecular Mycology; CHU Henri Mondor Créteil; Laboratoire de Parasitologie et de Mycologie Médicale Strasbourg; Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS); Laboratoire de parasitologie et de mycologie médicales CHU Amiens; CHU Amiens-Picardie; Service de parasitologie et mycologie CHRU de Besançon; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon); AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard Paris; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP); CHU Pitié-Salpêtrière AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU); Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Service de parasitologie et mycologie médicale Hôpital de la Croix Rousse, Lyon; Hôpital de la Croix-Rousse CHU - HCL; Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL); CHU Rouen; Normandie Université (NU); Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (CHU de Montpellier); Pôle Biologie-Pathologie CHRU Montpellier; Centre Hospitalier Régional Universitaire Montpellier (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire Montpellier (CHRU Montpellier); Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon); Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon); CHU Bordeaux; Hôpital Cochin AP-HP; Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse); Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nice; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-Université Côte d'Azur (UniCA); Hôpital universitaire Robert Debré Reims (CHU Reims); Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle (ESCAPE); Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN); Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES); Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité); Hôpital Necker - Enfants Malades AP-HP; Centre hospitalier Valenciennes, Nord; Laboratoire de Parasitologie et Mycologiede CHRU Brest; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest); Hôpital Universitaire Carémeau Nîmes (CHU Nîmes); Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes); Service de Parasitologie Avicenne; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Sorbonne Paris Nord; CHU Montpellier; Centre Hospitalier Régional Universitaire Montpellier (CHRU Montpellier); Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille); Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées Brétigny-sur-Orge (IRBA); Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital (CHU de Poitiers La Milétrie ); Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset); Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique EHESP (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ); CHU Clermont-Ferrand; Hôpital Raymond Poincaré AP-HP; Hôpital Ambroise Paré AP-HP; Centre Hospitalier de Saint-Denis Ile-de-France; Centre Hospitalier Universitaire de Martinique Fort-de-France, Martinique; Centre Hospitalier de Beauvais; Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); The NRCMA is supported by Santé Publique France and Institut Pasteur
    • بيانات النشر:
      HAL CCSD
      American Society for Microbiology
    • الموضوع:
      2021
    • Collection:
      Université de Rennes 1: Publications scientifiques (HAL)
    • نبذة مختصرة :
      International audience ; The aim of this study was to evaluate diagnostic means, host factors, delay of occurrence, and outcome of patients with COVID-19 pneumonia and fungal coinfections in the intensive care unit (ICU). From 1 February to 31 May 2020, we anonymously recorded COVID-19-associated pulmonary aspergillosis (CAPA), fungemia (CA-fungemia), and pneumocystosis (CA-PCP) from 36 centers, including results on fungal biomarkers in respiratory specimens and serum. We collected data from 154 episodes of CAPA, 81 of CA-fungemia, 17 of CA-PCP, and 5 of other mold infections from 244 patients (male/female [M/F] ratio = 3.5; mean age, 64.7 ± 10.8 years). CA-PCP occurred first after ICU admission (median, 1 day; interquartile range [IQR], 0 to 3 days), followed by CAPA (9 days; IQR, 5 to 13 days), and then CA-fungemia (16 days; IQR, 12 to 23 days) (P < 10-4). For CAPA, the presence of several mycological criteria was associated with death (P < 10-4). Serum galactomannan was rarely positive (<20%). The mortality rates were 76.7% (23/30) in patients with host factors for invasive fungal disease, 45.2% (14/31) in those with a preexisting pulmonary condition, and 36.6% (34/93) in the remaining patients (P = 0.001). Antimold treatment did not alter prognosis (P = 0.370). Candida albicans was responsible for 59.3% of CA-fungemias, with a global mortality of 45.7%. For CA-PCP, 58.8% of the episodes occurred in patients with known host factors of PCP, and the mortality rate was 29.5%. CAPA may be in part hospital acquired and could benefit from antifungal prescription at the first positive biomarker result. CA-fungemia appeared linked to ICU stay without COVID-19 specificity, while CA-PCP may not really be a concern in the ICU. Improved diagnostic strategy for fungal markers in ICU patients with COVID-19 should support these hypotheses. IMPORTANCE To diagnose fungal coinfections in patients with COVID-19 in the intensive care unit, it is necessary to implement the correct treatment and to prevent them if ...
    • Relation:
      info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/34668768; hal-03404538; https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03404538; https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03404538/document; https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03404538/file/Spectrum.01138-21.pdf; PUBMED: 34668768
    • الرقم المعرف:
      10.1128/Spectrum.01138-21
    • الدخول الالكتروني :
      https://doi.org/10.1128/Spectrum.01138-21
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      https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03404538/document
      https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03404538/file/Spectrum.01138-21.pdf
    • Rights:
      info:eu-repo/semantics/OpenAccess
    • الرقم المعرف:
      edsbas.B5B8B61C