Segmenti mitohondrijske DNA u genomu stanične jezgre goveda ; Mitochondrial DNA segments in Catlle nuclear genome

U mnogim vrstama životinja (i ljudi) otkrivene su stotine sekvenci koje potječu od insercija mtDNA u nuklearni genom. Danas se te sekvence zovu numt-ovi (nuklearne mitohondrijske DNA) ili mitohondrijski pseudogeni. Međutim, distribucija numt-ova kod goveda se tek odnedavno počela istraživati. Cilj rada bio je identificirati i istražiti učestalost pojave segmenata mitohondrijske DNA u genomu jezgre goveda. Za istraživanje su korištene 33 sekvence iz projekta MitoTAUROmics te referentni kromosomi i mtDNA Bos taurusa i Bos indicusa koji su dostupni u javnim bazama podataka. Usporedbe su se radile uz pomoć BLAST+ softvera, a poravnanje sekvenci se radilo pomoću MEGA 7.0.26. softvera. Pronađeno je ukupno 156 potencijalnih numt-ova, od kojih je 86 potvrđeno. Iako su više kromosoma Bos indicusa imali podudaranja sa traženim sekvencama, sama duljina segmenata je bila veća kod Bos taurusa. Najduži numt ima 6393 pb, dok najkraći 27 pb. Podudarnost između numt-ova i mtDNA varira od 70% do 100%. Ukupna duljina fragmenata kod Bos taurusa je bila 57189 pb, što je 3,5 puta dulje od ukupne duljine mitogenoma. Duljina fragmenata Bos indicusa je 30609 pb, što je 1,9 puta dulje od ukupne duljine mitogenoma. U mtDNA Bos taurusa identificirano je 5 potpunih gena koji kodiraju proteine, a to su 12s rRNA, COX1, COX2, COX3, ATP6 koji su pronađeni u 9 numt-ova. Kod Bos indicusa identificirano je 6 potpunih gena: ND3, ND6, ATP6, ATP8, COX3, ND4L u 5 numt-ova. Većina ostalih numt-ova kodira mt-tRNA gene. Iako su otkriveni geni koji kodiraju proteine, potrebna su daljnja istraživanja radi provjere funkcionalnosti numt-ova koji kodiraju mt-tRNA molekule. ; In many animal species (and humans), hundreds of sequences, which originated from the insertion of mtDNA into the nuclear genome, have been discovered. Today, these sequences are called numts (nuclear mitochondrial DNAs) or mitochondrial pseudogenes. However, the distribution of cattle numts has only recently begun to be investigated. The aim of the study was to identify and investigate ...