Vztah struktury a funkce a využití RTX proteinů gramnegativních bakterií ; Structure-function relationships and use of RTX proteins of Gram-negative bacteria

Označení RTX (Repeat in ToXin) spojuje početnou a stále se rozrůstající skupinu proteinů rozličných funkcí. Pro všechny její členy, mezi něž se řadí například toxiny, metaloproteasy, lipasy, proteiny S-vrstvy, bakteriociny a proteiny s dosud neobjasněnou funkcí, jsou typické následující charakteristiky: i) přítomnost nonapeptidové a na glycin bohaté vápník-vazebné konsensus sekvence GGXGXDX[L/I/V/W/Y/F]X (kde X může být jakýkoliv aminokyselinový zbytek) v různém počtu opakování (6-50) v C-koncové části proteinu; ii) k sekreci proteinu z buňky dochází bez přítomnosti periplasmatického intermediátu mechanismem zahrnujícím rozpoznání C-koncového sekrečního signálu proteiny asociovanými s cytoplasmatickou membránou, které následně exportují protein do kanálu procházejícího skrze celou bakteriální buněčnou stěnu ven z buňky (sekreční systém typu I); iii) geny pro syntézu strukturního proteinu, jeho aktivaci a sekreci jsou většinou uskupeny v tzv. RTX operonu. Nejrozsáhlejší skupinu rodiny RTX proteinů tvoří RTX toxiny. Většinou se jedná o proteiny o molekulové hmotnosti mezi 100-200 kDa, posttranslačně modifikované acylací mastnou kyselinou. Acylace je zprostředkována specifickým aktivačním proteinem. Tato posttranslační modifikace je naprosto nezbytná pro aktivaci molekuly toxinu a jeho funkci a. ; RTX (Repeat in ToXin) superfamily consists of many proteins divided into several groups according to their different functions and characteristics: toxins, metalloproteases, lipases, proteins of the S-layer, bacteriocins and proteins with unknown function. However, all of them can be characterized by the following features: i) they contain tandemly repeated (6-50) nonapeptide glycine-rich calcium-binding consensus sequences GGXGXDX[L/I/V/W/Y/F]X (where X is any amino acid residue) in the C-terminal part of the protein. The presence of these repeats is a sine qua non condition for RTX protein family membership; ii) secretion from the cell occurs without a periplasmic intermediate by a mechanism which involves recognition ...