Contributors: Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord; Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM); Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes (IPC); Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Immunologie des maladies virales, auto-immunes, hématologiques et bactériennes (IMVA-HB); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay; Centre National de Référence des virus des infections respiratoires (dont la grippe) - National Reference Center Virus Influenzae Paris (CNR - laboratoire coordonnateur); Institut Pasteur Paris (IP); Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses (GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2)); Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité); Unité des Virus Emergents (UVE); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI); École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon); Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Virpath-Grippe, de l'émergence au contrôle -- Virpath-Influenza, from emergence to control CIRI (Virpath); Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon); Plateforme de Microbiologie Mutualisée (PIBnet) - Mutualized Platform for Microbiology (P2M); Epidémiologie des Maladies Emergentes - Emerging Diseases Epidemiology; Institut Pasteur Paris (IP)-Conservatoire National des Arts et Métiers CNAM (CNAM); Centre National de Référence des Virus des Infections Respiratoires (dont la Grippe) Lyon (CNR - laboratoire associé); Institut des Agents Infectieux Lyon (IAI); Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL); This work was funded by the French national research agency (ANR) through the TheraCoV ANR-20-COVI-0018 (JG) and also by the Bill & Melinda Gates Foundation through INV-017335 (JG).; ANR-20-COVI-0018,TheraCoV,Dynamique virale au niveau individuel et populationnel : implications pour l'optimisation des stratégies antivirales(2020)
نبذة مختصرة : International audience ; Non-human primates infected with SARS-CoV-2 exhibit mild clinical signs. Here we used a mathematical model to characterize in detail the viral dynamics in 31 cynomolgus macaques for which nasopharyngeal and tracheal viral load were frequently assessed. We identified that infected cells had a large burst size (>10 4 virus) and a within-host reproductive basic number of approximately 6 and 4 in nasopharyngeal and tracheal compartment, respectively. After peak viral load, infected cells were rapidly lost with a half-life of 9 hours, with no significant association between cytokine elevation and clearance, leading to a median time to viral clearance of 10 days, consistent with observations in mild human infections. Given these parameter estimates, we predict that a prophylactic treatment blocking 90% of viral production or viral infection could prevent viral growth. In conclusion, our results provide estimates of SARS-CoV-2 viral kinetic parameters in an experimental model of mild infection and they provide means to assess the efficacy of future antiviral treatments.
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