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Impact of receptor clustering on ligand binding.

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  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Artificial Evolution and Computational Biology (BEAGLE); Laboratoire d'InfoRmatique en Image et Systèmes d'information (LIRIS); Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École Centrale de Lyon (ECL); Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon); Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École Centrale de Lyon (ECL); Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE); Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN); Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon); Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
    • بيانات النشر:
      HAL CCSD
      BioMed Central
    • الموضوع:
      2011
    • Collection:
      Institut National de la Recherche Agronomique: ProdINRA
    • نبذة مختصرة :
      International audience ; BACKGROUND: Cellular response to changes in the concentration of different chemical species in the extracellular medium is induced by ligand binding to dedicated transmembrane receptors. Receptor density, distribution, and clustering may be key spatial features that influence effective and proper physical and biochemical cellular responses to many regulatory signals. Classical equations describing this kind of binding kinetics assume the distributions of interacting species to be homogeneous, neglecting by doing so the impact of clustering. As there is experimental evidence that receptors tend to group in clusters inside membrane domains, we investigated the effects of receptor clustering on cellular receptor ligand binding. RESULTS: We implemented a model of receptor binding using a Monte-Carlo algorithm to simulate ligand diffusion and binding. In some simple cases, analytic solutions for binding equilibrium of ligand on clusters of receptors are provided, and supported by simulation results. Our simulations show that the so-called "apparent" affinity of the ligand for the receptor decreases with clustering although the microscopic affinity remains constant. CONCLUSIONS: Changing membrane receptors clustering could be a simple mechanism that allows cells to change and adapt its affinity/sensitivity toward a given stimulus.
    • Relation:
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    • الرقم المعرف:
      10.1186/1752-0509-5-48
    • الدخول الالكتروني :
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    • Rights:
      info:eu-repo/semantics/OpenAccess
    • الرقم المعرف:
      edsbas.9D491BC7