SARS-CoV-2’nin genom organizasyonu

Coronaviridae ailesi Orthocoronavirinae ve Letovirinae olmak üzereiki alt aileden oluşmaktadır. Orthocoronavirinae alt ailesi serolojikve genetik özelliklerine göre alfa, beta, gamma ve delta olmak üzere4 ayrı genusta (cins) incelenmektedir. Coronaviridae ailesinde yeralan viruslar zarflı, 80-220 nm boyutunda ve pleomorfik yapıda olmalarına rağmen, çoğunlukla küresel görünüm sergilemektedir. Buviruslar 20 nm uzunluğunda belirgin ve taç şeklinde trimer spike adıverilen yüzey çıkıntılarına sahiptir. Coronaviruslar büyük RNA genomuna sahip olmaları nedeniyle mutasyon ve rekombinasyon türügenom değişimleri, bu viruslarda daha fazla görülmektedir. Özellikleyarasa CoV'larının doğada çok sayıda farklı konakçı türünde sirküleolabilmesi, rekombinasyon ve mutasyon oranının artmasına ve yenipatojen CoV'ların ortaya çıkmasına yol açabilmektedir. Coronavirusların çoğalması konak hücrenin sitoplazmasında gerçekleşmektedir.Bu viruslar replikasyon için ilk önce S proteini ile hücre yüzey reseptörlerine tutunurlar. CoV'un konakçıda enfeksiyon oluşturabilmesinde ve doku tropizminde temel belirleyici, virus S proteini ve konakhücre yüzey reseptörü arasındaki ilişkidir. SARS-CoV-2, Anjiyotensindönüştürücü enzim 2'nin (Angiotensin-converting enzyme 2 - ACE2)farklı bölgelerine bağlanmaktadır. ACE2, kardiak fonksiyonu ve kanbasıncının dengelenmesi için önemli bir hücre yüzeyi çinko-bağlayıcı karboksipeptidaz olarak tanımlanmaktadır. SARS-CoV-2'nin, yenibir pandeminin etiyolojik ajanı olarak tanımlanması ile birlikte yarasa kökenli Coronavirusların moleküler biyolojisi ve patogenezine yönelik ilgiyi bir kez daha uyandırmıştır. Bu çalışmalar SARS-CoV-2’yekarşı oldukça kısa bir süre içinde spesifik antiviral ajan ve aşılarıngeliştirilmesi için kullanılabilecek çok sayıda fonksiyonel ve yapısalbilgi üretmiştir ; The Coronaviridae family consists of two subfamilies Orthocoronavirinae and Letovirinae. Orthocoronavirinae subfamily is examined in 4 different genus (genus) as alpha, beta, gamma and delta according to their serological and ...