نبذة مختصرة : Fundamento: el mimetismo entre la glicoproteína S de SARS-CoV-2 y moléculas humanas puede ser parte de los mecanismos implicados en las afectaciones causadas por el virus en órganos dianaObjetivo: identificar, con el empleo de herramientas bioinformáticas, el mimetismo molecular y las interacciones entre la glicoproteína S y proteínas humanas.Métodos: se seleccionaron cinco epítopes T de la glicoproteína S de SARS-CoV-2, presentados por HLA-A*0201 y HLA-DRB1*0301, para buscar secuencias homólogas en la base de datos de antígenos tumorales TANTIGEN, mediante la herramienta BLASTP. Se escogieron aquellas proteínas humanas con al menos seis aminoácidos compartidos y más del 60 % de similitud. Sus características fueron tomadas de la base de datos UniProt y la representación de sus interacciones con otras proteínas humanas fue modelada en STRING. Los resultados fueron comparados con las interacciones predichas de la glicoproteína S con proteínas humanas, según Bio-Grid.Resultados: en la base de datos TANTIGEN se encontraron 11 proteínas humanas con similitud para los epítopes T de la gp S. Entre ellas, CSPG4 aparece reportada entre las interacciones de la gp S. Las proteínas identificadas participan en vías metabólicas, de señalización y activación celular. Se identificaron diez moléculas con interacción por cada una de las proteínas humanas: F2, USP10, SMU1, LPHN2 y GPC3, que aparecen como potenciales interactores con gp S de SARS-CoV-2.Conclusiones: el mimetismo entre los epítopes de la glicoproteína S y las proteínas humanas puede ser parte de los mecanismos patogénicos durante la infección por SARS-CoV-2. ; Background: mimicry between SARS-CoV-2 S glycoprotein and human molecules may be part of the mechanisms involved in the damages caused by the virus to target organs.Objective: to identify, with the use of bioinformatic tools, the molecular mimicry and interactions between S glycoprotein and human proteins.Methods: five SARS-CoV-2 S glycoprotein T cell epitopes, presented by HLA-A*0201 and HLA-DRB1*0301, were ...
Relation: http://revzoilomarinello.sld.cu/index.php/zmv/article/view/2810/pdf_801; http://revzoilomarinello.sld.cu/index.php/zmv/article/view/2810/pdf_802; Li J, Liu HH, Yin XD, Li CC, Wang J. COVID-19 illness and autoimmune diseases: recent insights. Inflammation Research [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 70(4): 407-428. Disponible en: https://doi.org/10.1007/s00011-021-01446-1.; Serrano-Barrera OR. Predicción de la inmunogenicidad de la proteína del SARS-CoV-2 responsable de la infección COVID-19 en humanos. Revista Electrónica Dr. Zoilo E. Marinello Vidaurreta [revista en internet]. 2020 [citado 24 de mayo 2021]; 45(3). Disponible en: http://revzoilomarinello.sld.cu/index.php/zmv/article/view/2270.; Bohn MK, Hall A, Sepiashvili L, Jung B, Steele S, Adeli K. Pathophysiology of COVID-19: Mechanisms Underlying Disease Severity and Progression. Physiology [revista en internet]. 2020 [citado 24 de mayo 2021]; 35(5): 288-301. Disponible en: https://doi.org/10.1152/physiol.00019.2020.; Liu Y, Sawalhab AH, Lu Q. COVID-19 and autoimmune diseases. Curr Opin Rheumatol [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 33(2): 155-162. Disponible en: https://dx.doi.org/10.1097%2FBOR.0000000000000776.; Abbas AK, Lichtman AH, Pillai Shiv. Inmunología Celular y Molecular. 8va ed. Barcelona: Elsevier Saunders; 2015.; Song J, Han J, Liu F, Chen X, Qian S, Wang Y, et al. Systematic Analysis of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Receptor ACE2 in Malignant Tumors: Pan-Cancer Analysis. Front. Mol. Biosci. [revista internet]. 2020 [citado 24 May 2021]; 7: 569414. Disponible en: https://dx.doi.org/10.3389%2Ffmolb.2020.569414.; Bao R, Hernandez K, Huang L, Luke JJ. ACE2 and TMPRSS2 expression by clinical, HLA, immune, and microbial correlates across 34 human cancers and matched normal tissues: implications for SARS-CoV-2 COVID-19. Journal for Immuno Therapy of Cancer [revista en internet]. 2020 [citado 24 de mayo 2021]; 8(2): e001020. Disponible en: https://dx.doi.org/10.1136%2Fjitc-2020-001020.; Gottschalk G, Knox K, Roy A. ACE2: At the crossroad of COVID-19 and lung cancer. Gene Reports [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 23(2021): 101077. Disponible en: https://doi.org/10.1016/j.genrep.2021.101077.; Karaderi T, Bareke H, Kunter I, Seytanoglu A, Cagnan I, Balci D, et al. Host Genetics at the Intersection of Autoimmunity and COVID-19: A Potential Key for Heterogeneous COVID-19 Severity. Front. Immunol. [revista en internet]. 2020 [citado 24 de mayo 2021]; 11: 586111. Disponible en: https://dx.doi.org/10.3389%2Ffimmu.2020.586111.; Shah S, Danda D, Kavadichanda C, Das S, Adarsh MB, Negi V. Autoimmune and rheumatic musculoskeletal diseases as a consequence of SARS-CoV-2 infection and its treatment. Rheumatology International [revista en internet]. 2020 [citado 24 de mayo 2021]; 40: 1539-1554. Disponible en: https://link.springer.com/article/10.1007/s00296-020-04639-9.; Paradoa ML, Middleton D, Acosta A, Sarmiento ME, Leyva J. Genes HLA en una muestra de la población cubana. Vaccimonitor [revista en internet]. 2000, Sep [citado 24 de mayo 2021]; 9(3): 1-5. Disponible en: https://www.redalyc.org/pdf/2034/203415536001.pdf.; Ferrer A, Nazábal M, Companioni O, de Cossío MEF, Camacho H, Cintado A, et al. HLA class I polymorphism in the Cuban population. Human Immunology. [revista en internet]. 2007 [citado 24 de mayo 2021]; 68(11): 918-927. Disponible en: https://doi.org/10.1016/j.humimm.2007.09.002.; Zhang G, Chitkushev L, Olsen LR, Keskin DB, Brusic V. TANTIGEN 2.0: a knowledge base of tumor T cell antigens and epitopes. BMC Bioinformatics [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 22: 40. Disponible en: https://doi.org/10.1186/s12859-021-03962-7.rtu.; Oldstone MBA. Molecular Mimicry as a Mechanism for the Cause and as a Probe Uncovering Etiologic Agent(s) of Autoimmune Disease. Molecular Mimicry [revista en internet]. 1989 [citado 24 de mayo 2021]; (145). Disponible en: https://doi.org/10.1007/978-3-642-74594-2_11.; Dotan A, Muller S, Kanduc D, David P, Halpert G, Shoenfeld Y. The SARS-CoV-2 as an instrumental trigger of autoimmunity. Autoimmunity Reviews [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 20(4): 102792. Disponible en: https://doi.org/10.1016/j.autrev.2021.102792.; Batista-Duharte A, Téllez B, Tamayo M, Portuondo D, Cabrera O, Sierra G, et al. Identificación in silico del mimetismo molecular entre epitopes T de Neisseria meningitidis B y el proteoma humano. Rev. Peru Med. Exp. Salud Pública [revista en internet]. 2013 [citado 24 de mayo 2021]; 30(3): 441-5. Disponible en: https://doi.org/10.17843/rpmesp.2013.303.281.; Adiguzel Y. Molecular mimicry between SARS-CoV-2 and human proteins. Autoimmunity Reviews [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 20(4): 102791. Disponibe en: https://dx.doi.org/10.1016%2Fj.autrev.2021.102791.; He C, Hua X, Shun S, Li S, Wang J, Huang X. Integrated Bioinformatic Analysis of SARS-CoV-2 Infection Related Genes ACE2, BSG and TMPRSS2 in Aerodigestive Cancers. Journal of Inflammation Research [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 14: 791-802. Disponible en: https://dx.doi.org/10.2147%2FJIR.S300127.; Dettore GM, Patel M, Gennari A, Pentheroudakis G, Romano E, Cortellini A, et al. The systemic pro-inflammatory response: targeting the dangerous liaison between COVID-19 and cancer. ESMO OPEN CANCER HORIZONS [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 6(3). Disponible en: https://doi.org/10.1016/j.esmoop.2021.100123.; Bora VR, Patel BM. The Deadly Duo of COVID-19 and Cancer! Front. Mol. Biosci. [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 8: 643004. Disponible en: https://doi.org/10.3389/fmolb.2021.643004.; Catalá Gonzalo A, Galván Casas C. COVID-19 y piel. Actas Dermosifiliogr. [revista en internet]. 2020 [citado 24 de mayo 2021]; 111(6): 447-449. Disponible en: https://dx.doi.org/10.1016%2Fj.ad.2020.04.007.; González González F, Cortés Correa C, Peñaranda Contreras E. Manifestaciones cutáneas en pacientes con COVID-19: características clínicas y mecanismos fisiopatológicos postulados. Actas Dermo-Sifiliográficas [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 112(4): 314-323. Disponible en: https://doi.org/10.1016/j.ad.2020.11.013.; Seeherman S, Suzuki YJ. Viral Infection and Cardiovascular Disease: Implications for the Molecular Basis of COVID-19 Pathogenesis. Int. J. Mol. Sci. [revista en internet]. 2021 [citado 24 de mayo 2021]; 22(4): 1659. Disponible en: https://www.mdpi.com/1422-0067/22/4/1659#.; Lo MW, Kemper C, Woodruff TM. COVID-19: Complement, Coagulation, and Collateral Damage. The Journal of Immunology [revista en internet]. 2020 [citado 24 de mayo 2021]; 205(6). Disponible en: https://doi.org/10.4049/jimmunol.2000644.; Orozco-Hernández JP, Marin-Medina DS, Sánchez-Duque JA. Manifestaciones neurológicas de la infección por SARS-CoV-2. Semergen [revista en internet]. 2020 [citado 24 de mayo2021]; 46(S1): 112-116. Disponible en: https://dx.doi.org/10.1016%2Fj.semerg.2020.05.004.; http://revzoilomarinello.sld.cu/index.php/zmv/article/view/2810
Processing Request
No Comments.