Genome-wide screening of lectin putative genes from Sorghum bicolor L., distribution in QTLs and a probable implications of lectins in abiotic stress tolerance ... : فحص على نطاق الجينوم للجينات المفترضة للكتين من Sorghum ثنائي اللون L.، والتوزيع في QTLs والآثار المحتملة للكتين في تحمل الإجهاد اللاأحيائي ...

Background Sorghum bicolor is one of the most important crops worldwide with the potential to provide resilience when other economic staples might fail against the continuous environmental changes. Many physiological, developmental and tolerance traits in plants are either controlled or influenced by lectins; carbohydrate binding proteins. Hence, we aimed at providing a comprehensive in silico account on sorghum's lectins and study their possible implication on various desired agronomical traits. Results We have searched sorghum's genome from grain and sweet types for lectins putative genes that encode proteins with domains capable of differentially binding carbohydrate moieties and trigger various physiological responses. Of the 12 known plant lectin families, 8 were identified regarding their domain architectures, evolutionary relationships, physiochemical characteristics, and gene expansion mechanisms, and they were thoroughly addressed. Variations between grain and sweet sorghum lectin homologs ... : خلفية مجردة الذرة الرفيعة ذات اللونين هي واحدة من أهم المحاصيل في جميع أنحاء العالم مع القدرة على توفير المرونة عندما تفشل المواد الأساسية الاقتصادية الأخرى ضد التغيرات البيئية المستمرة. يتم التحكم في العديد من السمات الفسيولوجية والتنموية والتسامح في النباتات أو تتأثر بالليكتينات ؛ البروتينات المرتبطة بالكربوهيدرات. وبالتالي، كنا نهدف إلى توفير حساب شامل في السيليكو على ليكتين الذرة الرفيعة ودراسة آثارها المحتملة على مختلف الصفات الزراعية المرغوبة. النتائج لقد بحثنا في جينوم الذرة الرفيعة من أنواع الحبوب والحلويات عن الجينات المفترضة للكتين التي تشفر البروتينات ذات المجالات القادرة على ربط أجزاء الكربوهيدرات بشكل تفاضلي وتحفز استجابات فسيولوجية مختلفة. من بين 12 عائلة ليكتين نباتية معروفة، تم تحديد 8 منها فيما يتعلق ببنى مجالها، والعلاقات التطورية، والخصائص الفيزيائية الكيميائية، وآليات التوسع الجيني، وتم تناولها بدقة. تشير الاختلافات بين متجانسات ليكتين الحبوب والذرة الرفيعة الحلوة من حيث وجود/غياب بعض المجالات المشتركة الأخرى مثل المحول المرتبط بالنيوكليوتيدات والمشترك بين APAF -1 و R -بروتينات و CED -4 ...