Contributors: North Dakota State Univ, Dept Microbiol Sci, Fargo, ND USAFargo, ND USA; Department of Environmental Systems Science ETH Zürich (D-USYS); Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology Zürich (ETH Zürich); Agroscope, Plant Soil Interact Grp, Zurich, Switzerland; Instituto de Ciencias Agrarias (ICA) Calle de Serrano 115 b, 28006 Madrid, Spain; Agroécologie Dijon; Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté COMUE (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro); UMR Eco&Sols Vientiane, Laos; Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols); Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier; Univ Complutense Madrid, Fac Farm, Dept Farmacol Farmacognosia & Bot, Madrid, Spain; North Dakota State University (NDSU); Integrative Ecology Group; Swedish Univ Agr Sci, Dept Forest Mycol & Plant Pathol, Uppsala, Sweden; Universidad de Alicante; Free University of Berlin (FU); Universität Zürich Zürich = University of Zurich (UZH); ANR-16-EBI3-0004,digging_deeper,Agro-ecosystem diversification: digging deeper(2016)
نبذة مختصرة : International audience ; Abstract Soil fungi are a key constituent of global biodiversity and play a pivotal role in agroecosystems. How arable farming affects soil fungal biogeography and whether it has a disproportional impact on rare taxa is poorly understood. Here, we used the high-resolution PacBio Sequel targeting the entire ITS region to investigate the distribution of soil fungi in 217 sites across a 3000 km gradient in Europe. We found a consistently lower diversity of fungi in arable lands than grasslands, with geographic locations significantly impacting fungal community structures. Prevalent fungal groups became even more abundant, whereas rare groups became fewer or absent in arable lands, suggesting a biotic homogenization due to arable farming. The rare fungal groups were narrowly distributed and more common in grasslands. Our findings suggest that rare soil fungi are disproportionally affected by arable farming, and sustainable farming practices should protect rare taxa and the ecosystem services they support.
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