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An Automated Pipeline for the Analysis of PET Data on the Cortical Surface

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  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Sorbonne Université (SU); Algorithms, models and methods for images and signals of the human brain (ARAMIS); Sorbonne Université (SU)-Inria de Paris; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM); Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Service de Neuroradiologie CHU Pitié-Salpêtrière; CHU Pitié-Salpêtrière AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU); FRONTlab - Systèmes frontaux : fonctions et dysfonctions (FRONTlab); Centre de référence sur les démences rares et maladie de Pick; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU); Laboratoire d'Imagerie Biomédicale (LIB); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Centre d'Acquisition et de Traitement des Images Paris; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA); Service de médecine nucléaire CHU Pitié-Salpétrière
    • بيانات النشر:
      HAL CCSD
      Frontiers
    • الموضوع:
      2018
    • Collection:
      Archive ouverte HAL (Hyper Article en Ligne, CCSD - Centre pour la Communication Scientifique Directe)
    • نبذة مختصرة :
      International audience ; We present a fully automatic pipeline for the analysis of PET data on the cortical surface. Our pipeline combines tools from FreeSurfer and PETPVC, and consists of (i) co-registration of PET and T1-w MRI (T1) images, (ii) intensity normalization, (iii) partial volume correction, (iv) robust projection of the PET signal onto the subject's cortical surface, (v) spatial normalization to a template, and (vi) atlas statistics. We evaluated the performance of the proposed workflow by performing group comparisons and showed that the approach was able to identify the areas of hypometabolism characteristic of different dementia syndromes: Alzheimer's disease (AD) and both the semantic and logopenic variants of primary progressive aphasia. We also showed that these results were comparable to those obtained with a standard volume-based approach. We then performed individual classifications and showed that vertices can be used as features to differentiate cognitively normal and AD subjects. This pipeline is integrated into Clinica, an open-source software platform for neuroscience studies available at www.clinica.run.
    • Relation:
      hal-01950933; https://hal.inria.fr/hal-01950933; https://hal.inria.fr/hal-01950933/document; https://hal.inria.fr/hal-01950933/file/Marcoux_Colliot_An_automated_pipeline_for_the_analysis_of_PET_data_on_the_cortical_surface.pdf
    • الرقم المعرف:
      10.3389/fninf.2018.00094
    • الدخول الالكتروني :
      https://hal.inria.fr/hal-01950933
      https://hal.inria.fr/hal-01950933/document
      https://hal.inria.fr/hal-01950933/file/Marcoux_Colliot_An_automated_pipeline_for_the_analysis_of_PET_data_on_the_cortical_surface.pdf
      https://doi.org/10.3389/fninf.2018.00094
    • Rights:
      info:eu-repo/semantics/OpenAccess
    • الرقم المعرف:
      edsbas.6AC350D8