Contributors: European Bioinformatics Institute Hinxton (EMBL-EBI); EMBL Heidelberg; ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science (ABIMS); Fédération de recherche de Roscoff (FR2424); Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR); Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR); Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Universidade do Algarve (UAlg); Computational Biology Unit Bergen (CBU); University of Bergen (UiB); Department of Agrotechnology and Food Sciences Wageningen; Wageningen University and Research Wageningen (WUR); CNR - Bari; Univ West England, Dept Appl Sci, Bristol BS16 1QY, Avon, England; Luxembourg Centre For Systems Biomedicine (LCSB); Université du Luxembourg = University of Luxembourg = Universität Luxemburg (uni.lu); Analyse Bio-Informatique pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM); Génomique métabolique (UMR 8030); Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE); Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut Français de Bioinformatique (IFB-CORE); Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE); University of Crete Heraklion (UOC); Universiteit Gent = Ghent University = Université de Gand (UGENT); VIB-UGent Center for Medical Biotechnology; Laboratory of Molecular Bacteriology KU Leuven; Catholic University of Leuven = Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven); Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans (GOSEE); Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École Pratique des Hautes Études (EPHE); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Aix Marseille Université (AMU)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université de Toulon (UTLN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes 2016-2019 (UGA 2016-2019 )-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Ile-de-France )-Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay)-European Molecular Biology Laboratory (EMBL)-NANTES UNIVERSITÉ - École Centrale de Nantes (Nantes Univ - ECN); Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Université australe du Chili; Plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi); Mésocentre Clermont Auvergne; Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA); European Project: 211601,EC:FP7:INFRA,FP7-INFRASTRUCTURES-2007-1,ELIXIR(2007)
نبذة مختصرة : International audience ; Microbiome research has grown substantially over the past decade in terms of the range of biomes sampled, identified taxa, and the volume of data derived from the samples. In particular, experimental approaches such as metagenomics, metabarcoding, metatranscriptomics and metaproteomics have provided profound insights into the vast, hitherto unknown, microbial biodiversity. The ELIXIR Marine Metagenomics Community, initiated amongst researchers focusing on marine microbiomes, has concentrated on promoting standards around microbiome-derived sequence analysis, as well as understanding the gaps in methods and reference databases, and solutions to computational overheads of performing such analyses. Nevertheless, the methods used and the challenges faced are not confined to marine studies, but are broadly applicable to all other biomes. Thus, expanding this Community to a more inclusive ELIXIR Microbiome Community will enable it to encompass a broad range of biomes and link expertise across ‘omics technologies. Furthermore, engaging with a large number of researchers will improve the efficiency and sustainability of bioinformatics infrastructure and resources for microbiome research (standards, data, tools, workflows, training), which will enable a deeper understanding of the function and taxonomic composition of the different microbial communities.
Processing Request
No Comments.