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Prédire l'évolution de la maladie de Parkinson à l'aide de données cliniques et d'IRM fonctionnelles: reproduction et robustesse d'une étude

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  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Neuroimagerie: méthodes et applications (EMPENN); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAL, IMAGE ET LANGAGE (IRISA-D6); Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA); Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes); Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique); Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes); Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA); Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique); Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT); Department of Neurology and Neurosurgery Montreal; Montreal Neurological Institute and Hospital; McGill University = Université McGill Montréal, Canada -McGill University = Université McGill Montréal, Canada; Department of Computer Science and Software Engineering Montreal (CSE); Concordia University Montreal; Large Scale Collaborative Data Mining (LACODAM); Inria Rennes – Bretagne Atlantique; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7); This work was funded by the Michael J. Fox Foundation for Parkinson's Research (MJFF-021134).; This work was also funded by a MITACS Global Research Award (IT34055).; This work was partially funded by Region Bretagne (ARED MAPIS).; ANR-20-THIA-0018,AI4SDA,IA pour l'analyse de données sémantiques(2020)
    • بيانات النشر:
      HAL CCSD
    • الموضوع:
      2024
    • Collection:
      Université de Rennes 1: Publications scientifiques (HAL)
    • الموضوع:
    • نبذة مختصرة :
      Ce travail a gagné le prix du meilleur poster en imagerie médicale, sponsorisé par Guerbet, à la conférence IABM 2024. ; National audience ; La maladie de Parkinson est une pathologie neurodégénérative fréquente pour laquelle il n’existe pas de biomarqueurs établis pour le diagnostic des stades précoces et la prédiction de la progression de la maladie [1]. Récemment, plusieurs études ont exploré des biomarqueurs de neuro-imagerie avec des techniques d’apprentissage automatique [2]. Néanmoins, ces études sont sensibles à plusieurs sources de variabilité, y compris celles introduites par différentes méthodes d'analyse [3], [4], rendant essentiel l’évaluation de leur robustesse. Nous avons tenté de reproduire (mêmes données, même méthode) et de répliquer (données ou méthode différentes) les modèles décrits dans [5] pour prédire l'état actuel et la progression de la maladie de Parkinson. Nous avons utilisé les données de la base de données Parkinson's Progression Markers Initiative [6] (PPMI), pour reproduire la cohorte, les mesures de neuro-imagerie (fALFF-ReHo) et les modèles d'apprentissage automatique grâce aux informations disponibles dans l'article et le code. Des variations méthodologiques ont aussi été étudiées, notamment pour la sélection de la cohorte, le traitement d’image et les variables utilisées (Figure-1). Les performances obtenues sont supérieures au hasard pour tous nos modèles, mais restent différentes de celles rapportées dans l'étude originale (Figure-2). Les difficultés rencontrées lors de cette reproduction s'expliquent notamment par la complexité des études de neuro-imagerie, en particulier en milieu clinique. Certaines variations ont mené à des performances plus proches de celles de l’étude originale pour certaines prédictions, mais pour d'autres, celles-ci étaient beaucoup plus faibles, suggérant la faible taille de l’effet détecté et la faible puissance de ces modèles.
    • Relation:
      inserm-04531392; https://inserm.hal.science/inserm-04531392; https://inserm.hal.science/inserm-04531392/document; https://inserm.hal.science/inserm-04531392/file/abstract-iabm2024-egermani.pdf; https://inserm.hal.science/inserm-04531392/file/germani-elodie-empenn.pdf
    • الدخول الالكتروني :
      https://inserm.hal.science/inserm-04531392
      https://inserm.hal.science/inserm-04531392/document
      https://inserm.hal.science/inserm-04531392/file/abstract-iabm2024-egermani.pdf
      https://inserm.hal.science/inserm-04531392/file/germani-elodie-empenn.pdf
    • Rights:
      http://creativecommons.org/licenses/by/ ; info:eu-repo/semantics/OpenAccess
    • الرقم المعرف:
      edsbas.56C2BE49