Ligand-based drug design against Herpes Simplex Virus-1 capsid protein by modification of limonene through in silico approaches ... : تصميم عقار قائم على الربيطة ضد بروتين قفيصة فيروس الهربس البسيط 1 عن طريق تعديل الليمونين في مناهج السيليكو ...

The pharmacological effects of limonene, especially their derivatives, are currently at the forefront of research for drug development and discovery as well and structure-based drug design using huge chemical libraries are already widespread in the early stages of therapeutic and drug development. Here, various limonene derivatives are studied computationally for their potential utilization against the capsid protein of Herpes Simplex Virus-1. Firstly, limonene derivatives were designed by structural modification followed by conducting a molecular docking experiment against the capsid protein of Herpes Simplex Virus-1. In this research, the obtained molecular docking score exhibited better efficiency against the capsid protein of Herpes Simplex Virus-1 and hence we conducted further in silico investigation including molecular dynamic simulation, quantum calculation, and ADMET analysis. Molecular docking experiment has documented that Ligands 02 and 03 had much better binding affinities (− 7.4 ... : إن التأثيرات الدوائية للليمونين، وخاصة مشتقاته، هي حاليًا في طليعة الأبحاث لتطوير الأدوية واكتشافها وكذلك تصميم الأدوية القائم على البنية باستخدام مكتبات كيميائية ضخمة منتشرة بالفعل في المراحل المبكرة من التطوير العلاجي والدوائي. هنا، يتم دراسة العديد من مشتقات الليمونين حسابيًا لاستخدامها المحتمل ضد البروتين القفيصي لفيروس الهربس البسيط -1. أولاً، تم تصميم مشتقات الليمونين عن طريق التعديل الهيكلي متبوعًا بإجراء تجربة الالتحام الجزيئي ضد البروتين القفيصي لفيروس الهربس البسيط -1. في هذا البحث، أظهرت درجة الالتحام الجزيئي التي تم الحصول عليها كفاءة أفضل ضد البروتين القفيصي لفيروس الهربس البسيط -1، وبالتالي أجرينا المزيد من التحقيق في السيليكو بما في ذلك المحاكاة الديناميكية الجزيئية، والحساب الكمومي، وتحليل ADMET. وثقت تجربة الالتحام الجزيئي أن Ligands 02 و 03 لهما تقارب ربط أفضل بكثير (-7.4 سعرة حرارية/مول و-7.1 سعرة حرارية/مول) مع البروتين القفيصي لفيروس الهربس البسيط -1 من الأسيكلوفير القياسي (-6.5 سعرة حرارية/مول). بعد مزيد من التحقيق، لوحظ أن الانتماءات الملزمة للليمونين الأولي ضعيفة قليلاً. ولكن بما في ...