Phylogenetic analysis of the viral proteins VP4/VP7 of circulating human rotavirus strains in China from 2016 to 2019 and comparison of their antigenic epitopes with those of vaccine strains ... : التحليل الوراثي للبروتينات الفيروسية VP4/VP7 لسلالات فيروس الروتا البشري المتداولة في الصين من 2016 إلى 2019 ومقارنة حاتماتها المستضدية مع سلالات اللقاح ...

Group A rotaviruses (RVAs) are the most common etiological agents of severe acute diarrhea among children under 5 years old worldwide. At present, two live-attenuated RVA vaccines, LLR (G10P[15]) and RotaTeq (G1-G4, G6 P[8], P[5]), have been introduced to mainland China. Although RVA vaccines can provide homotypic and partially heterotypic protection against several strains, it is necessary to explore the genetic and antigenic variations between circulating RVAs and vaccine strains. In this study, we sequenced viral protein VP7 and VP4 outer capsid proteins of 50 RVA strains circulating in China from 2016 to 2019. The VP7 and VP4 sequences of almost all strains showed high homology to those of previously reported human strains and vaccine strains of the same genotype. However, in the presumed antigenic epitopes of the VP7 and VP4, multiple amino acid variations were found, regardless of the G and P genotypes of these strains. Moreover, all circulating G3 RVA strains in China potentially possess an extra ... : فيروسات الروتا من المجموعة أ (RVAs) هي العوامل المسببة الأكثر شيوعًا للإسهال الحاد الشديد بين الأطفال دون سن الخامسة في جميع أنحاء العالم. في الوقت الحاضر، تم إدخال لقاحين RVA موهنين حيين، LLR (G10P [15]) و RotaTeq (G1 - G4، G6 P[8]، P[5])، إلى البر الرئيسي للصين. على الرغم من أن لقاحات RVA يمكن أن توفر حماية متماثلة النمط وجزئية غير متجانسة النمط ضد العديد من السلالات، إلا أنه من الضروري استكشاف الاختلافات الجينية والمستضدية بين RVA المنتشرة وسلالات اللقاح. في هذه الدراسة، قمنا بتسلسل البروتين الفيروسي VP7 و VP4 بروتينات القفيصة الخارجية من 50 سلالة RVA المتداولة في الصين من 2016 إلى 2019. أظهرت تسلسلات VP7 و VP4 لجميع السلالات تقريبًا تماثلًا عاليًا مع تلك السلالات البشرية المبلغ عنها سابقًا وسلالات اللقاح من نفس النمط الجيني. ومع ذلك، في الحواتم المستضدية المفترضة لـ VP7 و VP4، تم العثور على اختلافات متعددة في الأحماض الأمينية، بغض النظر عن الأنماط الجينية G و P لهذه السلالات. علاوة على ذلك، من المحتمل أن تمتلك جميع سلالات G3 RVA المتداولة في الصين موقعًا إضافيًا للجلوكوزيل المرتبط بـ N مقارنة بسلالة G3 ...