Contributors: Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer (CIRC - IARC); Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office Genève, Suisse (OMS / WHO); Stanford University; Universidad de O'Higgins (UOH); Centre de modélisation mathématique / Centro de Modelamiento Matemático Santiago (CMM); Universidad de Chile = University of Chile Santiago (UCHILE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Barcelona Institute of Science and Technology (BIST); Instituto de Salud Carlos III Madrid (ISC); University of California San Diego (UC San Diego); University of California (UC); Cornell University New York; Universidad de Córdoba = University of Córdoba Córdoba; Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba (IMIBIC); Universidad de Córdoba = University of Córdoba Córdoba -Hospital Universitario Reina Sofía; Hospital Universitario Reina Sofía de Córdoba; CIBER Fisiopatología de la Obesidad y Nutrición Cordoue, Espagne (CIBEROBN); Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL); Centre Léon Bérard Lyon -Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Centre Léon Bérard Lyon; Cypath and Cypath-rb Villeurbanne (2C); Tumorothèque du Centre de Référence Régional en Cancérologie CHRU Lille (T-C2RC); Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire CHU Lille (CHRU Lille)-Institut de Pathologie de Lille (IPL); Hôpital Nord CHU - APHM; Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)); École Pratique des Hautes Études (EPHE); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité); Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital (CHU Nantes); FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge CHU Nice (OncoAge); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA); Université Côte d'Azur (UniCA); Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN); Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA); Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice); Hôpital Pasteur Nice (CHU); Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL); Centre de Ressources Biologiques - Nancy (CRB Nancy); Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy); Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3); Université de Toulouse (UT); Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse); Hôpital Marie-Lannelongue; Tissu-Tumorothèque Est - Centre de Ressources Biologiques HCL, Lyon (2TE - CRB HCL); Hospices Civils de Lyon (HCL); Réseau d'expertise anatomopathologique et de recherche sur les tumeurs de la plèvre CHU Caen (MESOPATH); CHU Caen; Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN); Service Anatomie et cytologie pathologiques CHU Toulouse; Pôle Biologie CHU Toulouse; Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse); Centre de Ressources Biologiques - Cancer - IUCT Oncopole Toulouse (CRB - Cancer Toulouse); Tumorothèque - Centre de Ressources Biologiques Cancer Cochin Hôpital Cochin AP-HP (T-CRB Cancer Cochin); Hôpital Cochin AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupes hospitalo-universitaires Paris Centre AP-HP Paris (GHU Paris Centre); Thérapies Assistées par Lasers et Immunothérapies pour l'Oncologie - U 1189 (OncoThAI); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire CHU Lille (CHRU Lille); Santé publique France - French National Public Health Agency Saint-Maurice, France; Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH); Institut de Biologie François JACOB (JACOB); Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA); Cologne Center for Genomics Cologne (CCG); University of Cologne; Hospital Universitario Reina Sofia Cordoue, Espagne; Université Grenoble Alpes (UGA); Plateforme anatomopathologie recherche Lyon-Est; Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard Lyon -Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Owkin, Inc. New York, NY, États-Unis; Institut Curie Paris; Institut Mutualiste de Montsouris (IMM); Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ); Université Paris-Saclay; Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats = Catalan Institution for Research and Advanced Studies (ICREA); ANR-10-INBS-0009,France Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010)
نبذة مختصرة : International audience ; Abstract Malignant pleural mesothelioma (MPM) is an aggressive cancer with rising incidence and challenging clinical management. Through a large series of whole-genome sequencing data, integrated with transcriptomic and epigenomic data using multiomics factor analysis, we demonstrate that the current World Health Organization classification only accounts for up to 10% of interpatient molecular differences. Instead, the MESOMICS project paves the way for a morphomolecular classification of MPM based on four dimensions: ploidy, tumor cell morphology, adaptive immune response and CpG island methylator profile. We show that these four dimensions are complementary, capture major interpatient molecular differences and are delimited by extreme phenotypes that—in the case of the interdependent tumor cell morphology and adapted immune response—reflect tumor specialization. These findings unearth the interplay between MPM functional biology and its genomic history, and provide insights into the variations observed in the clinical behavior of patients with MPM.
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