Multi-omics analyses reveal rumen microbes and secondary metabolites that are unique to livestock species ... : تكشف التحليلات متعددة الأوميكس عن ميكروبات الكرش والمستقلبات الثانوية التي تنفرد بها أنواع الماشية ...

Ruminant livestock, including cattle, sheep, goats, and camels, possess a distinctive digestive system with complex microbiota communities critical for feed conversion and secondary metabolite production, including greenhouse gases. Yet, there is limited knowledge regarding the diversity of rumen microbes and metabolites benefiting livestock physiology, productivity, climate impact, and defense mechanisms across ruminant species. In this study, we utilized metataxonomics and metabolomics data from four evolutionarily distinct livestock species, which had fed on diverse plant materials like grass, shrubs, and acacia trees, to uncover the unique signature microbes and secondary metabolites. We established the presence of a distinctive anaerobic fungus called Oontomyces in camels, while cattle exhibited a higher prevalence of unique microbes like Psychrobacter, Anaeromyces, Cyllamyces, and Orpinomyces. Goats hosted Cleistothelebolus, and Liebetanzomyces was unique to sheep. Furthermore, we identified a set of ... : تمتلك الماشية المجترة، بما في ذلك الأبقار والأغنام والماعز والجمال، جهازًا هضميًا مميزًا مع مجتمعات ميكروبية معقدة ضرورية لتحويل الأعلاف وإنتاج المستقلب الثانوي، بما في ذلك غازات الدفيئة. ومع ذلك، هناك معرفة محدودة فيما يتعلق بتنوع ميكروبات الكرش والمستقلبات التي تفيد فسيولوجيا الثروة الحيوانية والإنتاجية وتأثير المناخ وآليات الدفاع عبر الأنواع المجترة. في هذه الدراسة، استخدمنا بيانات metataxonomics و metabolomics من أربعة أنواع من الماشية المتميزة تطوريًا، والتي تغذت على مواد نباتية متنوعة مثل العشب والشجيرات وأشجار السنط، للكشف عن الميكروبات المميزة الفريدة والمستقلبات الثانوية. لقد أثبتنا وجود فطر لاهوائي مميز يسمى Oontomyces في الإبل، في حين أظهرت الماشية انتشارًا أعلى للميكروبات الفريدة مثل Psychrobacter و Anaeromyces و Cyllamyces و Orpinomyces. استضافت الماعز Cleistothelebolus، وكانت Liebetanzomyces فريدة من نوعها للأغنام. علاوة على ذلك، حددنا مجموعة من الميكروبات الأساسية المحفوظة، بما في ذلك بريفوتيلا وريكينيلاسي وكلادوسبوريوم وبيكوراميسس، الموجودة في جميع الحيوانات المجترة، بغض النظر عن علم الوراثة ...