Resistance to African swine fever virus among African domestic pigs appears to be associated with a distinct polymorphic signature in the RelA gene and upregulation of RelA transcription ... : يبدو أن مقاومة فيروس حمى الخنازير الأفريقية بين الخنازير المحلية الأفريقية مرتبطة بتوقيع متعدد الأشكال متميز في جين RelA وزيادة تنظيم نسخ RelA ...

African swine fever virus (ASFV) is a highly contagious and fatal hemorrhagic disease of domestic pigs, which poses a major threat to the swine industry worldwide. Studies have shown that indigenous African pigs tolerate ASFV infection better than European pigs. The porcine v-rel avian reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (RelA) encoding a p65 kD protein, a major subunit of the NF-kB transcription factor, plays important roles in controlling both innate and adaptive immunity during infection with ASFV. In the present study, RelA genes from ASFV-surviving and symptomatic pigs were sequenced and found to contain polymorphisms revealing two discrete RelA amino acid sequences. One was found in the surviving pigs, and the other in symptomatic pigs. In total, 16 nonsynonymous SNPs (nsSNPs) resulting in codon changes were identified using bioinformatics software (SIFT and Polyphen v2) and web-based tools (MutPre and PredictSNP). Seven nsSNPs (P374-S, T448-S, P462-R, V464-P, Q478-H, L495-E, and ... : فيروس حمى الخنازير الأفريقية المجرد (ASFV) هو مرض نزفي شديد العدوى ومميت للخنازير المنزلية، والذي يشكل تهديدًا كبيرًا لصناعة الخنازير في جميع أنحاء العالم. أظهرت الدراسات أن الخنازير الأفريقية الأصلية تتسامح مع عدوى ASFV بشكل أفضل من الخنازير الأوروبية. يلعب تماثل جين الورم الفيروسي A (RelA) للخنزير v - rel للطيور الذي يشفر بروتين p65 kD، وهو وحدة فرعية رئيسية لعامل النسخ NF - kB، أدوارًا مهمة في التحكم في كل من المناعة الفطرية والتكيفية أثناء الإصابة بفيروس التهاب الفقار الروماتويدي. في هذه الدراسة، تم تسلسل جينات RelA من الخنازير الناجية من ASFV والأعراض ووجد أنها تحتوي على تعدد الأشكال التي تكشف عن تسلسلين منفصلين من الأحماض الأمينية RelA. تم العثور على أحدهما في الخنازير الباقية على قيد الحياة، والآخر في الخنازير التي تعاني من أعراض. في المجموع، تم تحديد 16 SNPs غير مرادفة (nsSNPs) مما أدى إلى تغييرات في الكودون باستخدام برنامج المعلوماتية الحيوية (SIFT و Polyphen v2) والأدوات المستندة إلى الويب (MutPre و PredictSNP). تم التنبؤ بسبعة nsSNPs (P374 - S و T448 - S و P462 - R و V464 - P و Q478 - H و L495 - E ...