Arbuscular mycorrhizal fungi assemblages in Chernozem great groups revealed by massively parallel pyrosequencing.

The arbuscular mycorrhizal (AM) fungal resources present in wheat fields of the Canadian Prairie were explored using 454 pyrosequencing. Of the 33 dominant AM fungal operational taxonomic units (OTUs) found in the 76 wheat fields surveyed at anthesis in 2009, 14 clustered as Funneliformis - Rhizophagus, 16 as Claroideoglomus, and 3 as Diversisporales. An OTU of Funneliformis mosseae and one OTU of Diversisporales each accounted for approximately 16% of all AM fungal OTUs. The former was ubiquitous, and the latter was mainly restricted to the Black and Dark Brown Chernozems. AM fungal OTU community composition was better explained by the Chernozem great groups ( P = 0.044) than by measured soil properties. Fifty-two percent of the AM fungal OTUs were unrelated to measured soil properties. Black Chernozems hosted the largest AM fungal OTU diversity and almost twice the number of AM fungal sequences seen in Dark Brown Chernozems, the great group ranking second for AM fungal sequence abundance. Brown Chernozems hosted the lowest AM fungal abundance and an AM fungal diversity as low as that seen in Gray soils. We concluded that Black Chernozems are most conducive to AM fungal proliferation. AM fungi are generally distributed according to Chernozem great groups in the Canadian Prairie, although some taxa are evenly distributed in all soil groups. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Les ressources en champignons mycorhizes arbusculaires (MA) de champs de blé des Prairies canadiennes ont été explorées par pyroséquençage 454. Parmi les 33 unités taxonomiques opérationnelles (UTO) dominantes de champignons MA trouvées dans 76 champs de blé examinés à l'anthèse, en 2009, 14 s'agrégeaient à Funneliformis-Rhizofagus, 16 à Claroideoglomus et 3 aux Diversisporales. Les UTO de deux MA, un Funneliformis mosseae et un Diversisporales, constituaient chacune approximativement 16 % de toutes les UTO de champignons MA. Le premier était ubiquiste alors que le deuxième était principalement limité aux chernozems noirs et brun foncé. La composition des UTO de la communauté de champignons MA s'expliquait davantage par les grands groupes de chernozems ( P = 0,044) que par les propriétés mesurées du sol. Cinquante-deux pourcent desUTO de champignons MA n'étaient non reliées aux propriétés mesurées du sol. Les chernozems noirs abritaient la diversité la plus élevée d'UTO de champignons MA et presque deux fois le nombre de séquences de champignons MA observées dans les chernozems brun foncé, le grand groupe se classant deuxième quant à l'abondance de séquences de champignons MA. Les chernozems bruns abritaient l'abondance la plus faible de champignons MA et leur diversité était aussi faible que celle des sols gris.Nous avons conclu que les chernozems noirs sont les plus propices à la prolifération des champignons MA. Les champignons MA sont généralement distribués selon les grands groupes de chernozems dans les Prairies canadiennes, quoique certains taxons soient distribués aléatoirement dans tous les groupes de sols. [ABSTRACT FROM AUTHOR]