Functional markers for selection of potyvirus resistance alleles at the pvr2-eIF4E locus in pepper using tetra-primer ARMS-PCR.

Functional markers targeted on single nucleotide polymorphisms (SNPs) responsible for phenotypic variation constitute optimal tools for marker-assisted selection (MAS) of resistance alleles with different specificities. Here, we used the tetra-primer ARMS-PCR procedure to assay SNP signatures of four distinct alleles at the pvr2-eIF4E locus, which controls pepper resistance to several potyviruses. These simple, economical, and codominant markers open the way for MAS of pepper genotypes resistant to the potyviral strains and species that are prevalent in distinct cultivation areas across the world. Les marqueurs moléculaires idéaux pour la sélection sont ceux qui révèlent directement le polymorphisme nucléotidique responsable de la variation phénotypique (marqueurs « fonctionnels »). Dans cet article, nous décrivons la mise au point de marqueurs utilisant la technique tetra-primer ARMS-PCR, qui permettent d’identifier quatre allèles de résistance aux potyvirus chez le piment, en exploitant les signatures nucléotidiques de ces allèles au gène pvr2-eIF4E. Ces marqueurs sont simples et peu coûteux à l’utilisation, ils sont codominants. Ils permettent de sélectionner, au sein de grands effectifs de plantes, les génotypes résistants spécifiquement à différents potyvirus et aux différentes souches de ces virus, qui varient en fonction des zones de culture du piment à travers le monde. [ABSTRACT FROM AUTHOR]