PREVALENCIA DE HONGOS FILAMENTOSOS EN GRANOS DE CAFÉ CULTIVADO EN NORTE DE SANTANDER, COLOMBIA.

PREVALENCE OF FILAMENT FUNGI IN COFFEE BEANS GROWN IN NORTE DE SANTANDER, COLOMBIA.

Contextualization: For more than a century, coffee has been the main product of the national economy, also the one that has had the greatest incidence in the socioeconomic development of Colombia; for this reason, it is relevant to check up the biotic and abiotic factors that affect coffee production, especially in the department of Norte de Santander. The coffee-growing zone of the department is located between 6°56'42" and 09°18'01" north latitude, and 72°01'13" and 73°38'25" west longitude. Knowledge gap: There are few studies related to fungal contaminants of coffee, in the region of Norte de Santander, which restraints the elucidation of variables and factors that contribute to the proliferation of them. That can affect quality and the risk of mycotoxin incidence in the coffee of that region. Purpose: The objective of this study was to determine the prevalence of fungi isolated during the processing stage of cherry coffee (Coffea arabica L.), produced in the different municipalities of the department of Norte de Santander. Methodology: Samples were taken in eight coffee-growing municipalities of the Department of Norte de Santander. At a microbiological level, phenotypic characteristics were determined with the help of taxonomic keys. At the genotypic level, the primers ITS4 and ITS5 of the fungal ribosomal DNA were used to perform a search, using the BLAST tool, in curated databases to determine the species. Physicochemical variables [pH, water activity and percent of moisture] were determined. An analysis of variance [ANOVA], the TUKEY multiple comparison or post-hoc tests, and a discriminant analysis were applied. Results and conclusions: Sixty axenic strains of filamentous molds were isolated from cherry coffee, grown in the coffee-growing municipalities of Norte de Santander. According to phenotypic characterization, the predominant fungi in the coffee beans were: Fusarium spp. (35%), Penicillium spp. (25%), Geotrichum spp. (22%) and Aspergillus spp. (15%). Molecular identification confirmed the presence of the genera Fusarium spp., Penicillium spp., Aspergillus spp. and Geotrichum spp. It was found that physicochemical variables determine the growth and proliferation of fungi in coffee beans; also, it was established that there are statistically significant differences and similarities in the municipalities sampled, that lead to establish two large groups correlated with each other, according to the physicochemical variables monitored. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Contextualización: el café ha sido, por más de un siglo, el principal producto de la economía nacional y, por tanto, el que mayor incidencia ha tenido en el desarrollo socioeconómico de Colombia; es por ello, de gran relevancia, monitorear los factores bióticos y abióticos que inciden en la producción del café, especialmente en el departamento Norte de Santander. La zona cafetera del departamento está comprendida entre los 6°56'42" y 09°18'01" de latitud norte y los 72°01'13" y 73°38'25" de longitud oeste. Vacío de conocimiento: los escasos estudios relacionados con los contaminantes fúngicos en el café [de la región de Norte de Santander] limitan dilucidar las variables y factores que contribuyen a la proliferación de estos, lo que puede afectar la calidad y aumentar el riesgo de incidencia de micotoxinas en el café de esa región. Propósito: el objetivo del estudio fue determinar la prevalencia de los hongos aislados en la etapa de procesamiento del café (Coffea arábica L.) tipo cereza, producido en los diferentes municipios de Norte de Santander. Metodología: Se realizaron muestreos en ocho municipios cafeteros del departamento Norte de Santander. A nivel microbiológico se determinaron las características fenotípicas con ayuda de claves taxonómicas. A nivel genotípico se utilizaron los iniciadores ITS4 e ITS5 del DNA ribosomal fúngico para realizar una búsqueda, mediante la herramienta BLAST, en base de datos curadas para determinar la especie. Se determinaron variables fisicoquímicas [pH, actividad de agua y porcentaje de humedad]. Se realizó un análisis de varianza [ANOVA], se aplicaron las pruebas de comparación múltiple o post-hoc de TUKEY y también un análisis discriminante. Resultados y conclusiones: A partir del café tipo cereza, cultivado en los municipios cafeteros de Norte de Santander, se aislaron 60 cepas axénicas de mohos filamentosos. De acuerdo con la caracterización fenotípica, los hongos predominantes en los granos de café fueron: Fusarium spp. (35 %), Penicillium spp. (25 %), Geotrichum spp. (22 %) y Aspergillus spp. (15 %). La identificación molecular confirmó la presencia de los géneros Fusarium spp., Penicillium spp., Aspergillus spp., y Geotrichum spp. Se encontró que las variables fisicoquímicas condicionan el crecimiento y proliferación de los hongos en los granos de café; también se determinó que existen diferencias estadísticamente significativas y similitudes entre los municipios muestreados, lo que permitió establecer dos grandes grupos correlacionados entre sí, de acuerdo con las variables fisicoquímicas monitoreadas. [ABSTRACT FROM AUTHOR]