Phenotypic and genotypic detection of carbapenemase production among gram negative bacteria isolated from hospital acquired infections.

VERONA (Italy); INDIA

Objectives: To identify the carbapenemase producing Gram-negative bacteria (GNB) by phenotypic methods and to confirm the presence of resistant genes using realtime polymerase chain reaction (PCR). Methods: This was a prospective study carried out at the Department of Microbiology, Sri Venkata Sai Medical College and Hospital, Mahabubnagar, India, from March 2018-2021. All samples were screened for carbapenem resistance by disc diffusion method and the VITEK®2 compact system (bioMérieux, France). Detection of carbapenemase was carried out using RAPIDEC®CARBA NP test (Biomeriux Private Limited, South Delhi, India), screening for metallo-β-lactamases (MBL) was carried out by double disk synergy test (DDST), and genotypic characterization by real-time PCR. Results: Among the 1093 Gram-negative bacilli identified, 220 (17.0%) were resistant to carbapenems by both tested methods. Carbapenemase detection using the RAPIDEC®CARBA NP test indicated that 207 (94.0%) were carbapenemase producers, of which 189 (91.2%) were MBL producers. The most common carbapenemase genes identified were New Delhi metallo-β-lactamase (NDM; 47.3%), followed by the co-existence of genes in combination of NDM, with Verona integron-mediated metallo-β-lactamase (VIM; 39.6%), VIM and oxacillin hydrolyzing enzymes-48 (OXA-48; 4.3%), and OXA-48 (1.4%).No gene of active on imipenem, Klebsiella pneumonia carbapenemase, VIM, or OXA-48 alone was detected. Conclusion: This study suggests routine carbapenem resistance testing among multi-drug resistant-GNBs, as most of these infections occur in hospitals. In addition, there is a possibility that these highly antibiotic-resistant genes could spread to other bacteria resulting in further dissemination. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

المنتجة للكاربابينيماز)GNB(الأهداف: التعرف على البكتيريا سالبة الجرام بالطرق المظهرية وتأكيد وجود الجينات المقاومة باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل .)PCR(في الوقت الحقيقي. المنهجية: أجريت هذه دراسة الاستطلاعية في قسم علم الأحياء الدقيقة بكلية ومستشفى سري فينكاتا ساي الطبي، ماهابوبناغار، الهند، خلال الفترة من مارس 2021-2018 م. فحصنا جميع العينات لمقاومة الكاربابينيم عن طريق طريقة فرنسا(. تم إجراء ،bioMérieux(المضغوط VITEK® انتشار القرص ونظام 2 ،RAPIDEC®CARBA NP الكشف عن كاربابينيماز باستخدام اختبار عن طريق اختبار تآزر)MBL(أجرينا كذلك فحص للكشف عن بيتا لاكتاماز .PCR والوصف الجيني عن طريق تفاعل ،)DDST(القرص المزدوج. 17.0%(النتائج: من بين 1093 عصية سالبة الجرام تم التعرف عليها، 220 كانت مقاومة للكاربابينيمات بالطريقتين المختبرتين. اكتشاف كاربابينيماز الهند(أشار ،Biomeriux(RAPIDEC®CARBA NP باستخدام اختبار 91.2 (من %(94.0 (من منتجي كاربابينيماز، منهم 189 %(إلى أن 207 كانت جينات كاربابينيماز الأكثر شيوعًا والتي تم تحديدها هي بيتا .MBL منتجي مع فيرونا إنجيغرون ،NDM لاكتاماز، يليها التعايش بين الجينات في توليفة من والأوكساسيلين VIM وانزيمات ،)VIM; بوساطة ميتالو بيتا لاكتاماز)% 39.6 لم يتم الكشف عن جين نشط .)OXA-48; 4.3%) ،OXA-48 (1.4%(.OXA- أو 48 VIM على إيميبينيم، ،والالتهاب الرئوي كليبسيلا و. GNBs الخلاصة: تقترح هذه الدراسة أن اختبار مقاومة الكاربابينيم الروتيني بين المقاوم للأدوية المتعددة، حيث تحدث معظم هذه العدوى في المستشفيات. بالإضافة إلى ذلك، هناك احتمال أن تنتشر هذه الجينات شديدة المقاومة للمضادات الحيوية إلى بكتيريا أخرى مما يؤدي إلى مزيد من الانتشار. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Copyright of Saudi Medical Journal is the property of Saudi Medical Journal and its content may not be copied or emailed to multiple sites or posted to a listserv without the copyright holder's express written permission. However, users may print, download, or email articles for individual use. This abstract may be abridged. No warranty is given about the accuracy of the copy. Users should refer to the original published version of the material for the full abstract. (Copyright applies to all Abstracts.)