Acidobacteria from oligotrophic soil from the Cerrado can grow in a wide range of carbon source concentrations.

Soils from the Brazilian Cerrado are nutrient-poor, acidic, and aluminum-rich. A previous study revealed that members of the phylum Acidobacteria were predominant in these oligotrophic soils. Five acidobacteria from Cerrado soil were isolated on VL-55 medium containing 0.05% of xylan as carbon source. All isolates belong to the Acidobacteria subdivision 1, and their 16S rRNA showed similarities of 94.2%–96% with Acidobacterium capsulatum or 98.6% with Edaphobacter aggregans. All isolates were able to sustain growth in a wide range of carbon source concentrations. Growth occurred in all concentrations of arabinose, dextrose, and xylose; only one isolate did not grow on fructose. Isolates grew poorly on N-acetyl-d-glucosamine at all concentrations tested. In general, increasing concentrations of these monosaccharides did not inhibit growth rates. Isolates exhibited growth on solid medium containing xylan, carboxymethyl cellulose, and colloidal chitin; however, growth was observed on solid medium that did not contain these polysaccharides. These isolates may be able to use the solidifying agents tested (gellan gum or agar) as carbon source. This interpretation is supported by the absence of growth in liquid media containing chitin or carboxymethyl cellulose at 0.05% as sole carbon source, whereas growth in the same conditions using xylan was confirmed. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Les sols du Cerrado Brésilien sont pauvres en éléments nutritifs, acides et riches en aluminium. Une étude antérieure a révélé que les acidobactéries représentaient le principal phylum retrouvé dans ces sols oligotrophes. Cinq acidobactéries issues de sols du Cerrado ont été isolées sur un milieu VL-55 contenant 0,05 % de xylane comme source de carbone. Tous les isolats appartenaient à la sous-division 1 des acidobactéries et leur ARNs 16S présentait des similitudes de 94,2 % à 96 % avec Acidobacterium capsulatum ou de 98,6 % avec Edaphobacter aggregans. Tous les isolats ont pu se développer en présence d'une large gamme de concentrations de la source de carbone. Toutes les concentrations d'arabinose, de dextrose et de xylose ont alimenté la croissance; un seul isolat n'a pu pousser dans du fructose. Les isolats ont eu du mal à se développer dans du N -acétyl-d-glucosamine à toutes les concentrations mises à l'essai. Règle générale, le fait de hausser les concentrations de ces monosaccharides n'a pas nui à la vitesse de croissance. Les isolats ont crû sur un milieu solide contenant du xylane, du carboxyméthylcellulose et de la chitine colloïdale; or, une croissance s'observait aussi sur un milieu solide ne renfermant pas ces polysaccharides. Ces isolats pourraient être capables de faire usage des substances gélifiantes (gomme gellane ou agar) comme source de carbone. Cette interprétation est corroborée par l'absence de croissance en milieu liquide renfermant 0,05 % de chitine ou du carboxyméthylcellulose comme unique source de carbone. En revanche, on a confirmé la croissance des isolats dans les mêmes conditions en présence de xylane. [Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]