Item request has been placed! ×
Item request cannot be made. ×
loading  Processing Request

Changes in the molecular genetic structure of Mycobacterium tuberculosis in Republic Sakha (Yakutia) in 2009–2024: spread of Beijing B0/W148 subtype ; Изменения в молекулярно-генетической структуры Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутии) за 2009–2024 годы: распространение субтипа Beijing B0/W148

Item request has been placed! ×
Item request cannot be made. ×
loading   Processing Request
اقرأ أكثر حفظ في قائمتي
  • معلومة اضافية
    • Contributors:
      Работа выполнена в рамках государственного задания № 121022500179-0.
    • بيانات النشر:
      Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems
    • الموضوع:
      2025
    • Collection:
      Acta Biomedica Scientifica
    • نبذة مختصرة :
      Introduction. In the Republic of Sakha (Yakutia) since 2020, the incidence of tuberculosis (TB) has become lower than the Russian average against the background of an increase in the proportion of multidrug-resistant (MDR) strains of Mycobacterium tuberculosis, including among new cases.Objective. To analyze the changes in the molecular genetic structure of M. tuberculosis strains for 2009–2024.Materials and methods. We studied 669 strains for 2009–2014 (first period) and 2022– 2024 (second period) by RD 207/105/181, SNPand MIRU-VNTR 24 typing methods.Results. The primary MDR (without pre-XDR and XDR) were 22.2 % and 24.6 % by periods, the pre-XDR increased from 1.0 % to 16.9 % and XDR strains were emergence in 3.3 % in 2022–2024. In the second period, the Beijing genotype was predominance (67.3 % vs. 43.3 % in the first period; p < 0.001), Beijing Central Asian Russian was increased from 21.7 % to 31.0 % (p = 0.006), Beijing B0/W148 was increased from 14.9 to 34.0 % (p < 0.001). Euro-American lineage was represented by endemic for Sakha (Yakutia) S genotype (13.8 % and 18.0 % by periods), genotypes T, LAM, Ural, H. In all age groups in the second period, an increase in the proportion of Beijing B0/W148 was found. The pre-XDR profiles of B0/W148 were increased (53,9 % vs 7,3 %; p < 0,001) and was found XDR (6.9 %). For genotype S, the primary pre-XDR (33,3 % vs 5,7 %; p = 0,002) was increased and XDR was found in 44.4 %.Conclusion. In the period of 2022–2024, in the M. tuberculosis population, a high level of pre-XDR and XDR in Beijing B0/W148 strains (60.8 %), and S genotype (60.1 %) was detected. Beijing B0/W148 strains have spread and influence MDR amplification, as the endemic S genotype, which requires further surveillance and control. ; Обоснование. В Республике Саха (Якутия) с 2020 года заболеваемость туберкулезом (ТБ) стала ниже среднероссийских показателей на фоне увеличения уровня первичной множественной лекарственной устойчивости (МЛУ) Mycobacterium tuberculosis.Цель исследования. ...
    • File Description:
      application/pdf
    • Relation:
      https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/5320/3026; Заболеваемость с впервые в жизни установленным диагнозом туберкулеза органов дыхания на 100 тыс. населения. URL: https://fedstat.ru/indicator/41711. [date of access: Jan 28, 2025]; Васильева И.А. Вопросы повышения качества противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации. 2023. URL: https://orenotd.orb.ru/upload/uf/6bc/r5ddprn0bgm612smhnqzvkxerk99qp2e/Vasileva-28.09.2023-VKS-Minzdrav-_5_5_-.pdf. [date of access: Jan 28, 2025]; Жданова С.Н., Огарков О.Б., Винокурова М.К., Алексеева Г.И., Кравченко А.Ф., Савилов Е.Д. Моделирование эпидемического распространения генотипа Вeijing Мycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутия). Туберкулез и болезни легких. 2017; 95(7): 40-47.; Синьков В.В., Алексеева Г.И., Жданова С.Н., Винокурова М.К., Прокопьев Е.С., Огарков О.Б. Место эндемичного для Республики Саха (Якутия) генотипа S возбудителя туберкулеза в глобальной филогении по результатам полногеномного секвенирования. Туберкулез и болезни легких. 2023; 101(5): 14-19. doi:10.58838/20751230-2023-101-5-14-19; Евдокимова Н.Е., Винокурова М.К., Жданова С.Н., Огарков О.Б., Кравченко А.Ф., Савилов Е.Д. Результаты лечения новых случаев туберкулеза легких в зависимости от основных генотипов Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутия). Туберкулез и болезни легких. 2021; 99(1): 41-47. doi:10.21292/2075-1230-2021-99-1-41-47; Винокурова Д.М., Томаска А.Г. Внутренняя и внешняя миграция в Республике Саха (Якутия): отношение студенческой молодежи. Власть и управление на Востоке России. 2021; 1(94): 177-187. doi:10.22394/1818-4049-2021-94-1-177-187; Жданова С.Н., Вязовая А.А., Лебедева И.Б., Синьков В.В., Кондратов И.Г., Шварц Я.Ш., и др. Циркуляция штаммов Mycobacterium tuberculosis Beijing Central Asian Outbreak в Кемеровской области — Кузбассе в 2018– 2022 годах. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024; 101(5): 628-640. doi:10.36233/0372-9311-571; Merker M, Barbier M, Cox H, Rasigade JP, Feuerriegel S, Kohl TA, et al. Compensatory evolution drives multidrug-resistant tuberculosis in Central Asia. Elife. 2018; 7: e38200. doi:10.7554/eLife.38200; Павленок И.В., Турсунова Н.В., Лацких И.В., Нарышкина С.Л., Смолина Е.А. Основные показатели противотуберкулезной деятельности в Сибирском и Дальневосточном федеральном округе (статистические материалы). – Новосибирск: 2023; 111.; Стерликов С.А., Васильева И.А., Михайлова Ю.В., Кудрина В.Г., Тестов В.В. Новое определение и эпидемиология туберкулеза с широкой лекарственной устойчивостью микобактерий туберкулеза в 2020 году. Туберкулез и болезни легких. 2023; 101(2): 14-19. doi:10.58838/2075-1230-2023-101-2-14-19; Габбасова Л.А., Касаева Т.Ч., Стерликов С.А., Нечаева О.Б., Обухова О.В., Одинцов В.Е. Отраслевые и экономические показатели противотуберкулёзной работы в 2009–2014 гг. Методика расчёта показателей и статистические материалы по результатам пятилетнего наблюдения. – М.: РИО ЦНИИОИЗ, 2015; 68.; Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Киселева Е.А., Черноусова Л.Н., Эргешов А.Э. Сравнительная молекулярно-генетическая характеристика культур Mycobacterium tuberculosis, выделенных в Европейской части Российской Федерации в 1998–2003 гг. и 2016–2021 гг. Туберкулез и болезни легких. 2023; 101(3): 27-36. doi:10.58838/2075-1230-2023101-3-27-36; Vyazovaya A, Gerasimova A, Mudarisova R, et al. Genetic Diversity and Primary Drug Resistance of Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype Strains in Northwestern Russia. Microorganisms. 2023; 11(2): 255. doi:10.3390/microorganisms11020255; Umpeleva T, Chetverikova E, Belyaev D, et al. Identification of genetic determinants of bedaquiline resistance in Mycobacterium tuberculosis in Ural region, Russia. Microbiol Spectr. 2024; 12: e03749-23. doi:10.1128/spectrum.03749-23; Vyazovaya A, Felker I, Schwartz Y, Mokrousov I. Population structure of Mycobacterium tuberculosis from referral clinics in Western Siberia, Russia: Before and during the Covid-19 pandemic. Infect Genet Evol. 2022; 103: 105343. doi:10.1016/j.meegid.2022.105343; Варламов Р.К., Прокопьев Е.С., Лугинова Е.Ф. Влияние ограничительных мероприятий по COVID-19 на выявляемость туберкулеза у детей и подростков. Туберкулез и болезни легких. 2024; 102(3): 71-75. doi:10.58838/2075-1230-2024-102-3-71-75; Trajman A, Felker I, Alves LC, Coutinho I, Osman M, Meehan SA, et al. The COVID-19 and TB syndemic: the way forward. Int J Tuberc Lung Dis. 2022; 26(8): 710-719. doi:10.5588/ijtld.22.0006; Жданова С.Н., Кондратов И.Г., Огарков О.Б. Выявление Mycobacterium tuberculosis Beijing Central Asian Outbreak в Иркутской области. Acta Biomedica Scientifica. 2024; 9(4): 237-247. doi:10.29413/ABS.2024-9.4.26; Merker M, Rasigade JP, Barbier M, et al. Transcontinental spread and evolution of Mycobacterium tuberculosis W148 European/Russian clade toward extensively drug resistant tuberculosis. Nat Commun. 2022; 13(1): 5105. doi:10.1038/s41467-022-32455-1; Синьков В.В., Огарков О.Б. Популяционная структура субтипа B0/W148 Mycobacterium tuberculosis: филогенетический анализ и особенности генотипической лекарственной устойчивости. Acta Biomedica Scientifica. 2024; 9(4): 248-259. doi:10.29413/ABS.2024-9.4.27; Mokrousov I, Badleeva M, Mudarisova R, Kozhevnikov V, Markhaev A, Guntupova A, et al. Increasing circulation of multi-drug resistant tuberculosis strains in Buryatia, high-burden and ethnically diverse region in the Russian Far East. Tuberculosis (Edinb). 2024; 149: 102555. doi:10.1016/j.tube.2024.102555; https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/5320
    • الرقم المعرف:
      10.29413/ABS.2025-10.2.24
    • الدخول الالكتروني :
      https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/5320
      https://doi.org/10.29413/ABS.2025-10.2.24
    • Rights:
      Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). ; Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
    • الرقم المعرف:
      edsbas.7316AED5